临床医学院的前身是成立于1958年的宁夏医学院医疗系，是学校建校之初即建立的系别；2006年3月，附属医院与临床医学系进行了实质性的院系合并；2008年10月，临床医学系正式更名为宁夏医科大学临床医学院。临床医学是宁夏医科大学建校之始即设立的专业，是国家级优势特色专业和学校的骨干专业，为一级学科硕士授权点，外科学为博士授权建设点。临床医学院设有临床医学、医学影像学、麻醉学3个本科专业及临床医学（妇幼、精神医学）2个专业方向。自2011年起临床医学专业纳入一本招生。临床医学院现有全日制在校本科生1806人，硕士研究生 480 人。有区内外实习基地12所，区内有直属附属医院宁夏医科大学总医院（2000张床位、全国百佳医院、三级甲等医院）、第二附属医院、附属石嘴山市第一人民医院等7所；区外有上海公利医院、山东医科大学附属医院、兰州空军总院等5所。现宁夏医科大附属医院改名宁夏医科大学总医院，下属有宁夏医科大学附属心脑血管病医院和宁夏医科大学附属肿瘤医院。
学院现有专任教师621名，其中：教授及副教授234名、主任医师201名；硕士生导师210名；博士36名，硕士338名；博士生导师8名。其中，享受国家级、省级政府特殊津贴专家9人；入选国家级、省级人才库19人。学院的临床技能培训中心和外科学实验室承担着本科生、研究生、留学生及各级各类医疗师资的培训任务，为省级实验教学示范中心（中央、地方共建单位），外科学实验室还是卫生部“中国医师协会外科基本技能培训基地”。 学院党委、行政本着“全心全意服务学生”的宗旨，紧扣“大学生就业文化艺术节”，建立了以“围绕‘就业’为核心的教学、科技、文化、艺术、体育和社会实践平台”，打造了特色鲜明的 “七彩校园文化”，全方位促进了大学生的成长。同时，按照“厚基础、宽口径、强技能”的培养目标，经过53年的建设与发展，依托总医院医疗集团的人才队伍、教学资源、学术氛围、医疗设和创新融合的医疗教学模式为培养医学人才提供了坚实的基础和保障，已经为国家培养和输送了临床医学等专业毕业生两万多名。2010年，本科生初次就业率达到83.33%。毕业生足迹遍布国内外，在各级卫生医疗机构中发挥了重要作用并创造出了骄人的成就。
学院现有自治区级重点学科4个——神经病学、心血管病学、骨外科学、呼吸内科学；自治区级精品课程5门——诊断学、妇产科学、外科学、儿科学、实验外科学；实验外科学国家级精品课程正在申报中，外科学为博士学位建设学科，自治区级重点课程1个——外科学；校级重点学科3个，校级精品课程7个。每年承担多项国家级、省部级和厅局级科技项目，发表科技论文400多篇、教学论文20多篇；近三年出版专著和教材9部；获得多项省部级、厅局级科技成果奖和教学成果奖。学院积极开展国际学术交流，先后选派120多名毕业生在美国、英国、日本等国家进行培训，并有新加坡、意大利、德国等国际专家来院参观、访问、进行学术交流。临床医学院按照“厚基础、宽口径、强技能”的培养目标，经过50年的建设和发展，专业成熟，学科齐全，师资力量雄厚，教学设施完备，教学质量过硬。依托附属医院雄厚的人才队伍、丰富的教学资源、浓郁的学术氛围、先进的医疗设备，良好的教学基地、创新融合的医疗教学模式为培养医学人才提供了坚实的保障。
50年来为国家培养输送医学专业毕业生一万多名，是宁夏及周边地区最大的医疗卫生人才培养基地。毕业生遍布国内外，在各级卫生医疗机构中发挥了重要作用并创造出骄人的成就。
