你的问题可以理解为多个样本同时测序，怎么区分样本
二代测序文库构建的步骤是这样的：
DNA样本的打断（每个样本独立做）
打断后的DNA的修补（修补缺口），然后加一个A碱基，随后基于所加的A碱基，连接接头。也就是这里是区分样本的关键，一般接头分为三部分 连接logo序列的互补序列+测序引物+barcord（即DNA条形码，这样可以通过几个碱基的组合来区分是什么样本，一般是P7接头是这样的，就不展开说了，想了解可以百度一下），所以每个样本也就可以理解为具有一个特征性的序列。
最后进行PCR，上机测序
数据分析时，基于barcord信息，区分不同样本的数据。
但是如果你不知道这个肉样的成分，它可能同时含有几种肉呢，难道在样本处理前先进性PCR后电泳分离纯化么，那就没有测序的意义了不是？
追答你的意思不同的肉是不同类型对样本
样本一般如果是同样来源，比如都是一个人的样本，那么这个人所有组织的DNA都是一样的（这里不谈体细胞突变）
如果里面含有几种肉，意思DNA序列是不一样的，如果同一来源（比如都是人），那么是区分不了。这个专业术语叫组织异质性，如果说不同来源，比如不通的物种，那么可以通过最后测序所得数据看一下来源什么物种。
还有一种单细胞测序，测序的样本来源为单细胞（即每次测序的样本为一个单细胞），所以可以区分。