1本2本3本的本质区别是：
总体上来说，一本大学大都是部委直属大学或者“211工程”大学，或者是985大学，也是高考第一批录取的大学。一本是“公办范畴”的大学，学制为四年，毕业证书和学位证书都是相同的，是不标明几本的，只表明是本科，都以自己高校的名称具印的教育证书。
二本大学与一本大学相比，多为省属大学或者非“211工程”大学，是高考中第二批录取的大学。在师资力量、硬件设施等方面两者还是有一定差距的。不过能考上一本大学的学生毕竟是少数，大多数学生的分数线只能考上二本院校。
三本大学主要是指“独立学院本科院校”等，是“公办民助范畴”的大学。如今大部分省份都取消了三本招生，因而现在三本大学变成了独立院校，三本大学与二本、一本大学相比并没有本质的区别，学制都一样是四年。但是三本的学费较贵，一般是1万-3万不等，而一本和二本大学的学费一般在5、6千左右。一般都是一本、二本大学学费的几倍。
拓展：
一本院校一般是985工程/211工程/部分高水平的省属重点、省部共建、小211工程高校，享受来自各方面的照顾，培养属于精英阶层的人才，师资、科研实力一般较强。
二本院校主要是省属本科院校和普通公办本科院校，综合实力通常低于在高考进行本科第一批录取的院校，有些全国高校中综合实力靠前的学校也在高考本科第二批中招生。
本科提前批、一批、二批和本科三批属于同一学历，性质相同，均为本科学历，学生毕业后颁发本科学历毕业证书和学士学位证书。但与专科批次有着本质的区别，专科毕业后颁发专科学历毕业证书，没有学位证书
一本和二本三本在分数线、录取批次、学费、办学范畴等方面是有不同的。要注意的是，现在已经没有一二三本之分了，都统称为本科。
1、一本，二本，三本由来主要是因为他们的分数线不同而导致的。各省市教育部门将不同层次的学校和不同分数段的考生安排在本科一批，二批，三批等批次来填取志愿和录取，不同的批次会有对应的最低分数线。一般来讲分数线是一本＞二本＞三本。但是现在基本上都统称为本科，只会公布本科的分数线。
2、录取批次不同。一本，二本，三本他们的录取批次是不一样的，分别对应本科一批，本科二批和本科三批，并且时间顺序是本科一批录取完之后再进行本科二批，以此类推。但是现在录取都是填报本科志愿没有时间的前后了。
3、学费不同。一本的学费相比来讲是最低的，其次是二本、三本。不过具体的情况还要具体分析，就比如说贵族学校的学费肯定贵。有的二本民办院校也比三本的院校学费要贵。
4、办学范畴不同。一本是公办范畴；二本多数是公办范畴，兼具少数民办；三本一般是公办民助范畴。
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