两者编制是一样的，无论是省直还是市州，只要是公务员，都属于公务员编制，没有区别。
待遇上有区别：
一、享受福利不同
1、省直事业单位待遇一般是财政直接拨款，享有完善的社会福利保障。
2、只有有绩效工资。各地情况不一。
二、级别上不同
1、省直机关是指经省级机构编制委员会批准设立的各省直行政事业单位。
2、市州相对等级低一些，福利待遇相对少些。
三、报考条件不同
1、市级报考则有市级单位和县级单位，还有乡镇单位，报考一般要求是本地户口。
2、省级公务员报考只要是本省大学生或本省户口都可以报考本省要求的编制。
省直机关包括：
政府办公厅、发改委、国资委、工业信息化厅、教育厅、科技厅、监察厅、民政厅、司法厅、财政厅、人力资源和社会保障厅、国土资源厅、环境保护厅、住房和城乡建设厅、交通运输厅、水利厅、农业厅、商务厅、卫生与健康委员会、文化厅、审计厅、外办、地税局、工商局、质监局、广电局、新闻出版局、体育局、安监局、统计局、林业局、粮食局、旅游局、民委、法制办、金融办、物价局、社保局、国税局、药监局、人防办、信访局、无线电管委会办公室、供销社、招商局、研究室、参事室、出版社、文史馆、农科院、社科院、招标局、机关事务局等。