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高通量测序分析
什么是普通的基因测序,它和
高通量测序
有什么区别吗
答:
“普通的基因测序”应该是指“常规
DNA测序
”吧,是用Sanger法(也就是双脱氧法)进行测序的方法,目前非常普遍的是直接用ABI 3730xl 进行的自动测序,基本上可以做到600bp-800bp的读长.
高通量测序
的概念其实是一个相对的概念,在2000年的时候,3700、MegaBace等仪器上的测序也是高通量测序,是相对手工测序...
如何破解新冠病毒基因组全长序列?
答:
其中更为重要的是,
高通量测序
还可以对病毒的序列进行组装,以获得病毒的全长基因组信息,这样为追溯病毒的来源、监测病毒的变异趋势以及探究致病机理提供了研究基础。科学家们为了获取完整的病毒基因组的序列,目前广泛应用到的高通量测序技术,就是将核酸序列打断成短片段从而进行测序,然后通过相应的
分析
...
什么是基因二代
测序
?
答:
第二代测序为
高通量测序
,采用微珠或高密度芯片边合成边测序,代表有454,solexa,solid,高通量,可一次获得数G数据,相对与第三代,都仍然需要扩增的方法放大信号,扩增后再检测。第二代测序技术的核心思想是边合成边测序(Sequencing by Synthesis),即通过捕捉新合成的末端的标记来确定DNA的序列,现有...
全外显子是根据什么建库的
答:
全外显子组测序是利用序列捕获技术,将全基因组外显子区域的DNA捕捉、富集之后,进行
高通量测序
的基因组
分析
方法。相较于全基因组重测序,外显子组测序在同样的通量下数据覆盖度更深,准确性更高,更加简便、经济、高效,目前已广泛应用于孟德尔遗传疾病、复杂疾病,以及癌症的研究中。优势:高覆盖度:有效覆盖外显子及...
测序
read数量是什么意思啊?
答:
测序reads数量代表:通过
高通量测序
技术获得的DNA或RNA片段的数量。这些片段通常被称为"reads",并且在基因组或转录组研究中具有重要的意义。以下是测序reads数量的一些主要代表意义:样本复杂性和覆盖度: 测序reads数量可以反映样本中DNA或RNA的复杂性。如果一个样本中的reads数量非常多,通常意味着该样本的...
单细胞
测序
应用及思路解析
答:
细胞裂解:将单个细胞进行裂解,释放其中的RNA、DNA等分子。库构建:将RNA、DNA等分子进行逆转录、扩增、建库等处理,构建出单细胞的转录组或基因组文库。测序:将构建好的文库进行
高通量测序
,产生大量的序列数据。数据
分析
:对测序数据进行分析,包括数据质量控制、比对、拼接、注释等步骤,得到单个细胞的...
高通量测序
数据公共数据库有哪些(高通量测序常规)
答:
GSDB收集、管理并且发布完整的
DNA
序列及其相关信息,以满足基因组
测序
中心需要。该数据库采用服务器-客户机关系数据库模式,大规模测序机构可以通过计算机网络向服务器提交数据,并在发送之前对数据进行检查,以确保数据的质量。GSDB数据库中条目的格式与GenBank中的基本一致,主要区别是GSDB数据库中增加了GSD...
如何对基因
测序
结果进行
分析
答:
一般情况系是通过荧光定量PCR,可以测定目的基因相对于标准基因的倍数,选取一定的基准,就能知道目的基因的数量。但是有时候由于DNA样本含量很少,会选用二代
高通量测序
的方法来检测染色体的倍数。测序得到基因序列后一般都需要进行序列比对,看和目的序列的差异情况,常用的软件有DNAman,还有invitrogen的vector...
你觉得
高通量测序
怎么样?为什么?
答:
夹在中间做测序是非常重复、流程化的工作。你要是作为科研人员,不要在测序、建库技术本身上面下太大功夫,那比较适合公司做。测序技术的发展,现在的测序仪的性能远远谈不上理想,要么读长短,要么错误率高。这离理想的测序技术还有非常大的距离。
高通量测序
的市场发展应当还是乐观的。别的不说,如果往...
宏基因组检测和全外显子检测有什么区别?
答:
宏基因组检测是做环境微生物的基因组。其关键在于环境的宏,包括人体内的环境,和自然环境等。通过对一个体系中所有存在的生物进行基因组层面的测序来
分析
个体在某个特定情况下中所存在的物种多样性,目前通常覆盖的病原体数目超过10000种。全外显子检测,强调全面,是
高通量测序
的一种方式。通常所说的...
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