本人在乡镇、县级、市级机关事业单位都曾工作过，就市直事业编和县区公务员如何选择给您一些建议。
就工作性质而言
市直事业单位：大的方向主要是根据工作职能负责对辖区内各县（市、区）相关工作的监督、协调、指导等工作。就目前而言，从中央到乡镇五个层级中，我认为只有市级工作是最轻松的，因为省管县制度的出台，市级日常业务基本是为省级单位上传下达、统计汇总。所以，总体而言，工作压力小，加班时候少，早八晚五的工作，惊不起任何波澜。
县区公务员：如果是党群部门如县（区）委办、组织部、宣传部等部门要比政府职能部门如交通局、人社局、水利局等要忙碌的多，加班是常有的事。县区相关部门都是面对下面各个乡镇和开发区的，工作着实不轻松，除了日常工作，需要经常下线检查，如遇省市部门还需做好迎检工作。工作压力相对较大。
就工资收入而言
市直事业单位：工资收入比县区事业单位稍高一点，但是，工资组成也基本一样，没有额外福利待遇，唯一，市直事业单位做的比较好一点的是，机关单位都有工会，传统节日会发一些米面油等福利，县区大多没有。工资增长途径来看，专技岗主要依靠职称晋级，管理岗主要是职务晋升，但是，一般事业单位级别都为正科级，也就是说成为科长也只是事业正科级，按目前来看，也就到顶了，工资收入受限制比较严重。
县区公务员：因为公务员身份，车补和年终绩效奖金是事业编制人员所没有的，也是让人羡慕的。正常除了基本工资组成，单车补和奖金一年下来约2万左右。这部分收入就比事业编要高很多。
就发展前景而言
市直事业单位：发展空间比较小，受编制限制，很难走向领导岗位，一般事业编人员的走向都是晋职称，到副高级职称退休都算是比较好的归宿了，如果单位职数不够，能不能聘任还不好说。至于管理岗位人员，到正科止步，虽然，理论上事业单位副科级满两年以上，可以通过调任，到机关单位任职副科级领导，但是，现实中能做到的情况不多，即要求有出色的工作能力，更要求有过硬的人脉实力。
县区公务员：发展空间比较好，一是在单位内解决实职副科级领导，也就是副局长职务，二是可以到乡镇任职，这个是比较常规的发展路径。即便以上两个途径都实现不了，也可以通过走职务和职级并行，根据年限逐步解决副领导职务，任四级或三级主任科员是没有问题的。
选择市直事业编还是县区公务员除了以上的分析还要结合您具体情况去决定，从家庭结构、年龄、专业性质去考虑。
当然，还有一种发展走向就是先到市直事业单位过渡，在工作不忙时，可以备考市直公务员，待有机会时通过省考选择更好的去处。