故事发生在19世纪上半叶，在密西西比河上的一个普通小镇，汤姆是个顽皮的孩子，他和他同父异母的弟弟在波莉的监护下，他总能想出各种恶作剧让波莉无计可施，他总能想方设法避免惩罚。一天，汤姆遇到了一个可爱的女孩贝基·撒切尔，撒切尔是法官的女儿，汤姆一看见她就喜欢她，他的爱似乎得到了回应。镇上有个孩子叫哈克贝利·费恩，他的父亲总是酗酒，他的父母总是吵架，所以，他跑出去独自生活，他看起来与文明社会格格不入。大人不喜欢他，但汤姆和他是好朋友。
有一天，他们约好晚上一起去墓地，但他们看到了意想不到的一幕。他们看见在混乱的打斗中，印第安·乔杀了医生，然后把责任推到被打昏了的波特身上。汤姆和哈克都很害怕，发誓决不告诉任何人，波特被捕后，汤姆感到很内疚，经常去看他。在这个时候，汤姆这边出了问题。贝基·撒切尔生他的气，没理他。波莉总是骂他，他觉得没有人关心他。汤姆、哈克和另一个孩子乘船去了一个小岛，但没过多久，他们就发现村里的孩子们，以为自己淹死了，正在寻找他们的尸体。汤姆晚上悄悄地回到波莉家，发现波莉在为他的死而悲伤，汤姆感到非常羞愧。
最后，当村民为他们举行葬礼时，他们三个人回来了。当夏天来临的时候，汤姆感到更加不安，因为法官将对波特的罪行做出判决，汤姆终于克服了恐惧和自私，指出印第安·乔才是凶手，但凶手还是逃走了，汤姆想出了另一个主意：寻宝。汤姆和哈克偶然发现，印第安·乔和他的一大笔不义之财。但他们不知道他把钱藏哪儿了。
哈克得知印第安人·乔要伤害道格拉斯寡妇，因为道格拉斯的丈夫把他送进了监狱，幸亏哈克及时通知，才避免了一场悲剧，但印第安·乔又逃走了。就在这时，汤姆和贝基在野餐时走进了一个山洞，他们被困在了里面，因为山洞太深了，他们找不到回去的路。他们在山洞里又遇到了印第安·乔，村民们竭尽全力救出汤姆和贝基，并把山洞封了起来。后来，汤姆告诉村民，印第安·乔还在洞里，当他们发现他时，他已经死在山洞里了，恶人罪有应得，汤姆和哈克再次回到山洞，找到了宝藏。
小说的故事发生在19世纪上半世纪美国密西西比河畔的一个普通小镇上。主人公汤姆·索亚天真活泼、敢于探险、追求自由，不堪忍受束缚个性、枯燥乏味的生活，幻想干一番英雄事业。
小说的时代在南北战争前，写的虽是圣彼得堡小镇，但该镇某种程度上可以说是当时美国社会的缩影。小说通过主人公的冒险经历，对美国虚伪庸俗的社会习俗、伪善的宗教仪式和刻板陈腐的学校教育进行了讽刺和批判，以欢快的笔调描写了少年儿童自由活泼的心灵。 2020年4月，列入《教育部基础教育课程教材发展中心 中小学生阅读指导目录（2020年版）》。