在清洁瑜伽球时，用清水或肥皂水清洗球的表面，不能用化学溶剂，它会毁坏球的表面。为了练习者的舒适以及清洁的原因，球应该定时的经常清洗，因为球的表层经常与地板接触。为了延长球的寿命，应保持房间地板的清洁，去除尖锐的物体。由于健身球的形状与型号，它的储存成为了许多健身房的一个难题。一种方法是用完之后直接撒气，放在原来的球盒里面。不要放在高温的地方。
还有一种方法则是买一张网，然后将球放在网中。如果是健身房的话最好的办法是在健身房四周手能够拿到的高度安装一根离墙40cm左右平衡于墙面的杆子，这样把球放在上面就不会占用场地。
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