1. 办公室负责制定和执行机关的议事规则和工作制度，承担机关综合、文秘、档案、会议、信息、督查、信访、保卫、保密、财务和政务公开等工作。
2. 人事处负责拟订自治区林业人才培训规划并组织实施；承办机关和直属单位的人事、劳资、机构编制、专业技术资格评审等工作；指导全区林业队伍建设。
3. 机关党委负责厅机关职工思想政治工作，开展社会主义精神文明建设活动；协调党组民主生活会，组织领导干部中心组学习；负责机关及在呼直属单位的党群工作。
4. 纪检组、监察室负责林业系统纪检、监察工作，监督处级以上党员干部执行党的路线、方针、政策的情况，查处领导干部违纪案件，提出处理意见。
5. 离退休人员工作处负责厅系统老干部工作计划、活动安排及经费预算的拟定和实施，协助有管部门搞好生活管理，组织指导厅属单位老干部工作。
6. 计划统计处研究提出自治区林业发展战略、中长期发展规划和年度计划，管理自治区级林业资金，监督全区林业资金的管理和使用。
7. 财务审计处根据国家有关财务规定，管理自治区林业资金，进行会计基础工作规范化管理，负责全区财务的下达和财务项目管理。
8. 治沙造林处组织、协调、指导和监督全区造林绿化工作，拟订标准和规程，并监督执行，指导各类公益林、商品林和特种用途林的培育。
9. 森林资源林政管理处组织、指导全区森林资源管理，拟订森林资源可持续经营政策措判没施和技术规程，编制并监督执行森林采伐限额。
10. 森林公安局负责全区森林公安队伍建设、警力配备、警籍、警衔管理，组织指导全区森林及野生动植物资源的保护。
11. 防火指挥部办公室承担自治区防火指挥部的日常工作，负责防火宣传教育、火情监测、火险预测预报、火灾调度统计和火灾信息发布。
12. 科技处组织、指导全区林业科学研究和技术推广工作，组织、指导林业科技体制改革、林业创新体系和林业技术推广体系建设。
13. 宣传办负责全区林业宣传工作，草拟全区林业宣传工作计划并组织实施，负责林业宣传重要稿件的撰写以及各种林业稿件的采集、选编。
14. 林业对外合作办公室负责编制全区林业生态建设利用外资的中长期规划，拟定项目管理办法，并组织实施。
15. 信息办负责全区林业信息化和林业电子政务建设规划及实施方案的拟定和实施，负责全区林业信息的开发利用、业务培训和信息服务。
16. 林业产业处编制全区林业产业化发展规划和产业政策并监督实施，指导全区林业产业的结构调整，负责林木、林产品加工、林产化工以及森林资源综合利用的行业管理。
17. 农村林业改革发展处组织、指导全区林业改革和农村牧区林业改革发展工作，指导、监督集体林权制度改革方针政策的落实。
18. 大兴安岭森林公安局负责大兴安岭国有林区森林公安工作计划，组织指导全区森林及野生动植物资源的保护，查处破坏森林及野生动植物资源案件。
19. 内蒙古自治区森林公安局大青山自然保护分局负责辖区内森林及野生动植物资源的保护，办理和侦办破坏森林及野生动植物资源的行政和刑事案件。
20. 内蒙古自治区森林公安局磴口沙漠林业分局负责辖区内森林及野生动植物资源保护、查处破坏森林及野生动植物资源案件，协助有关单位做好治安、警卫等工作。
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