主要是因为它们的功能不同，详见下记参考资料。
保税物流之“七剑下天山“
了解中国的保税物流，需要了解七个关键词语：保税仓、出口监管仓、保税区、出口加工区、保税物流园区、保税物流中心和保税港。如同“七剑下天山”是快意恩仇的武林传奇一样，这七个词语也是解读中国保税物流发展和变革历程的关键。到目前为止，我国海关已经发展成了四个层次、七种模式的现代海关监管体系。即“以保税港和区港联动的保税物流园区为龙头、以保税区，保税物流中心和出口加工区为枢纽，以优化的保税仓库和出口监管仓库为网点”的结构化体系。
出口监管仓一游龙剑：团队进攻的“先锋”随着社会分工的细化，出口暂存的需要，出口监管仓随即出现，按功能分为出口配送型出口监管仓和国内结转型出口监管仓。
保税仓—莫问剑：元老人物自从80年代，我国就存在保税仓库，它是指经海关批准设立的专门存放保税货物及其他未办结海关手续货物的仓库。它分为公共型保税仓库，即向社会提供保税仓储服务，以及仅存储本企业自用的保税货物的自用型保税仓库。
保税区一青干剑：光线初绽，令人避无可避进入90年代，由于多种经济成分、多种贸易方式的出现，以及对自由贸易的需求，国家引进了自由港、自由贸易区的概念，因而出现了保税区。到目前为止，国务院已经审批了15个保税区。保税区的四大功能包括保税加工、转口贸易、保税仓储、商品展示，并“免证、免税、保税”。但随着我国加入世贸所做承诺的逐步兑现，外贸经营权的放开、关税的逐步下调，都使得保税区在政策和功能上的优势相对弱化。
出口加工区一竞星剑：性情敦厚，善于防守虽然保税区引入了国外自由贸易的理念，但是由于我国进出口的管制较国外复杂，保税区的优势并没有完全发挥出来，同时还出现了一些利用国家政策进行骗取退税等行为。因此，2000年，国务院基于原来的保税区的政策，成立出口加工区。使加工贸易能够从保税区脱离出来，并且能够更好的利用保税区的出口加工的政策，提高海关监管。
保税物流中心一天瀑剑：忽攻忽守，意列随成保税物流园区的组成是依托邻近的保税区和港口，但这样的地理条件要求较高，为了满足其它没有这种特殊资源的地区的发展需要，2004年保税物流中心孕育而生，它消除了两仓的功能单一、相互隔离等缺点，并对两仓进行了整合、优化和提升，其功能相对于保税物流园区而言，只缺少了检测维修及商品展示的功能。保税物流中心分为A型和B型。保税物流中心的经营范围包括保税存储进出口货物及其他未办结海关手续货物；可对所存货物开展流通性简单加工和增值服务；进行全球采购和国际分拨、配送；转口贸易和国际中转；物流信息处理服务；经海关批准的其他国际物流业务。由此可见，保税物流中心是对两仓的整合、优化和提升。保税物流中心分为A型和B型，两者的功能是相通的，只是监管模式的不同。简单而言，A型是对两仓的整合和优化，而B型则是多个A型的集中布局，海关实施集中监管，B型的主体不能直接参加A型的经营和管理。保税物流中心的发展方向是国际采购中心、国际分拨中心和国际配送中心。
保税物流园区—日月剑：越打越耀眼由于保税区的地理限制，导致了进出口货物的二次报关问题，即货物由两个海关进行监管、需两次报关、两次查验、两次放行，和港口无联动，降低了通关的效率，增加了企业的物流成本。2003年“区港联动”的政策被提出，即利用保税区的政策优势和港口的区位优势，在两者之间建立起一个通道，保税物流园区就此出现。它是依托邻近的保税区和港口，强化保税区的功能，体现保税区的政策优势和港区的区位优势。2003年国家审批了第一家保税物流园区上海外高桥保税物流园区。除上海外，还包括青岛、大连、张家港、宁波、厦门、深圳等8个保税物流园区。保税物流园区具有七大功能，储存进出口货物及其他未办结海关手续的货物；对所存货物开展流通性简单加工和增值服务；进出口贸易包括转口贸易；国际采购、分销和配送；国际中转；检测维修；商品展示。开展“区港联动”的目的是将保税区的政策优势、功能优势与港口的区位优势进行整合，海关通过区域化、网络化、电子化通关管理，优化海关监管模式，打破保税区与港区长期以来的分离机制和瓶颈制约。一方面拓展港口的配套服务功能，形成保税区与港口的良性互动着力吸引国际中转、国际配送和临港增值服务等高附加值业务向我国转移；另一方面赋予保税物流园区齐全的物流功能，满足跨国公司普遍采用零库存、JIT、VMI、无缝隙对接等现代新型生产方式、管理方式、营销方式的需求，使加工制造业与物流业同步协调发展，为促进加工贸易转型升级提供配套的保税物流服务。现在保税物流园区的发展已经取得了初步成效，第一，它延长了加工链，促进了我国加工贸易转型升级；其次，它改变了保税区进口大于出口的现状，园区出口采购功能明显；第三，它对内陆地区的辐射和带动作用明显，加快了区域经济一体化；第四，海关对园区监管模式创新进行了有益的尝试，国际中转业务形成了从出口加工区——保税区保税物流中心——保税物流园区——境外一条能进、能出的双向保税物流产业链和保税物流循环圈，货物无需离境即可在保税状态下完成从初级产品到最终产品的转换，从而满足了跨国企业发展的需求。
保税港一舍神剑：蕴涵强烈生命力，无处不利2005年6月，为了使港口的发展更加适应世界贸易的需要，自由贸易港的概念的引入，保税港区的政策出台，它是目前政策级别最高、开放形式最宽，并且形式上基本与自由贸易港接轨。但只有经过国家认定具备国际航运中心资质的沿海城市才可以申请。
摘自世贸博客
追问没回答到主题上啊，功能不同，基本上后面的就比前面的多了一两项功能而已，会在退税方面产生什么影响呢，功能来说保税仓库、出口监管仓库和保税物流中心他们的功能都是仓储啊，也没什么不同但退税政策却不同
追答保税区拥有进行国际贸易、国际中转、保税仓储、物流、保税加工等功能，但它设置在港区之外，且没有出口退税功能，货物只有在实际离境之后才能进行出口退税。
出口加工区和保税物流园区都享受出口退税政策，货物自境内区外进入区内即可办理退税。但出口加工区的主要功能仅限于保税加工，区内除了可以进行出口加工和提供专为出口加工企业生产提供服务的仓储和货物进、出的运输服务，不得经营商业零售、一般贸易、转口贸易及其他与加工区无关的业务。出口加工区设置在港口之外，因此也没有口岸功能。
保税物流园区是应区港联动，整合保税区的仓储功能和邻近港口的装卸、运输功能，实现保税区域与港口一体化运作的需求而设立的，它是在保税区规划面积或者毗邻保税区的特定港区内设立的，在保税区和港区之间开辟直通式通道，专门发展现代国际物流业的海关特殊监管区域。保税物流园区具有国际贸易、国际中转、保税仓储等功能，货物入区退税，但不能进行加工制造业务。物流园区虽然有专门通道与港区相连，但在监管上仍与港口分属不同海关，因此不具有实际的口岸功能。
保税港区设立在国家对外开放口岸港区和与之相连的特定区域内，具有口岸、物流、加工、贸易等功能，拥有保税区、出口加工区、保税物流园区“三区合一”的政策优势，港区合一，是我国目前开放程度最高、政策最优的海关特殊监管区域。