蚂蚁金服的内资股东结构主要由4部分构成：
阿里巴巴集团和蚂蚁金服管理层、国字号参股公司、
马云的朋友圈参投公司和私募股权基金公司。其中，阿里巴巴集团和阿里/蚂蚁金服管理层持股大约83%，国字号公司持股10.68%，马云的朋友圈企业持股大约4.5%，私募股权基金持股大约1.75%。
蚂蚁金服的多级股权架构及有限合伙企业形式的设计主要有以下几种优势：
1、将员工
股权激励放在持股平台内，能有效扩充激励股东人数；
2、将员工股权激励放在持股平台内，能有效隔离蚂蚁金服公司的经营风险；
3、通过持股平台及多级股权架构降低了马云控制成本；
4、通过多级股权架构设计，有效隔离了控制人个人风险；
5、通过有限合伙持股平台，可以减少股东变动对公司的影响，以便实现股权动态调整。