吴传钧长期从事地理学的综合研究，是中国现代经济地理学与现代人文地理学的学科带头人。20世纪50年代提出经济地理学并非一般所说的经济科学，而是与自然科学及技术科学密切交叉，具有自然—技术—经济三结合特点的边缘科学。80年代提出地理学的中心研究课题是人地关系地域系统的发展过程、机理和结构特征、发展趋向和优化调控，这些学术见解推进了地理学的基础理论研究。吴传钧的研究是随着20世纪中期生产力的飞速发展和科学技术的巨大进步而进行的。他立足于地理学，广泛涉及人文地理学的诸多研究领域，并在学科建设、学术组织、人才培养等各个方面都有重要建树。
他研究农业地理就是从土地利用入手。他的“中国粮食地理”、“威远山区的土地利用”、“中国稻作经济”三篇学士、硕士、博士学位论文都属于这两个范畴。20世纪50年代初，他调查了南京市土地利用情况，并编制了中国第一幅大比例尺彩色土地利用图。随后，他参加了黑龙江流域综合考察，进行东北地区土地利用研究。60年代他从事一系列以农业区划为中心的工作。70年代初期，他进行大兴安岭地区宜农荒地资源考察，又到东南、西北和西南各省区进行农业生产典型调查。随后，他承担全国科技发展规划第108项重点任务。期间，由他负责设计、组织全国协作完成的755万字《中国农业地理丛书》，已由美国国会图书馆译成英文。他主编该丛书的主卷《中国农业地理总论》，对中国农业生产发展条件、特点、水平、潜力及地域差异进行了综合分析和理论概括。其中有关对商品粮基地建设和山区综合开发的论证均被生产部门所采纳。这项成果为后来由国家农业区划委员会主持的全国农业区划工作奠定了基础。80年代初，吴传钧受中国科学院委托，主持全国1∶100万土地利用图编制和研究的国家重点课题。所编制的《中国1∶100万土地利用图》，是他组织全国41个单位300人历时10年完成的世界上第一本全国规模的小比例尺土地利用图集。在该图集中，他创造性地设计了用底色、线条、符号、注记来表现3个层次66个类型的方法，使图面直观地反映了中国土地利用的地域差异和分布规律，超过了美、英、日、苏等国土地利用分类和制图水平，在设计水平、分类系统、图幅载量等各个方面均位居国际领先地位，成为中国搞好国土资源管理，制定农业发展规划，进行国力综合研究的科学依据。同时，在他领导下制定的《1∶100万土地利用制图规范》成为编制土地利用图以及开展全国性土地利用研究的指南。
吴传钧的研究在经济地理学上不断创新，开拓了国土整治研究新领域。他在研究中不只局限于农业地理，而是顺应国家经济发展各个阶段的形势和任务，来确定各个阶段的研究方向，面向整个经济地理学。20世纪50年代初期，他承担铁道部包头—银川—兰州的经济选线调查和黄河流域规划。50年代中期至60年代初期，他参加了中苏两国科学院合作的黑龙江流域综合考察、华北地区工业布局和工业用水调查。90年代，他虽年逾古稀，仍在主持“中国经济地理学的理论与实践”的自然科学基金项目研究。 吴传钧在国内外刊物上发表了160多篇论著。曾获得中国科协“周培源国际科技交流大奖”。他参与编写的《中国海岸带与海涂资源调查报告》和《中华人民共和国国家农业地图集》获国家科技进步奖一等奖，主编的《中国农业地理总论》、《1∶1000000 中国土地利用图集》、《中国土地利用》获中国科学院科技进步奖一等奖。专著《国土开发整治与规划》、《中国经济地理》等，对国土研究与规划提出了系统的理论和方法。
吴传钧早年回国后，受地处南京的中国地理研究所所长林超教授聘请，到该所工作。1953年，这个所被改组为中国科学院地理研究所，并于1958年由南京迁到北京，吴传钧历任该所研究员、副所长，中国地理学会、中国生态经济学会等全国性学会的正副理事长、秘书长，一些兄弟研究所和大学地理系的研究员、教授，《地理学报》等7个全国性学术刊物的顾问、主编、副主编，以及《中国地理学家》等3个外国出版的学术刊物的编委、联合国大学科学研究协调员、国际地理联合会副主席等数十个职务。
吴传钧作为一名科学家，具有崇高的思想品格。虽然他身居高位、成绩卓著，但虚怀若谷，从不居功自傲、盛气凌人，受到同行们的尊敬和爱戴。吴先生以他的高尚品德，在全国范围内培养和凝聚了大量的科学人才以及能够继往开来的学科队伍。吴先生晚年仍旧关心地理学事业的发展和地理学人才的成长，热心参与各种学术活动。
1吴传钧，中国粮食地理，商务印书馆，1942。
2吴传钧，经济地理学——生产布局的科学，科学通报，1960，19：21～24。
3吴传钧主编，中国农业地理总论，科学出版社，1980。
4吴传钧，地理学的特殊研究领域和今后任务，经济地理，1981，1(1)：1～5。
5Wu Chuanjun(EditorinChief),Geography in China,Science Press,1984.
6吴传钧主编，经济大辞典——国土经济·经济地理卷，上海辞书出版社，1988。
7吴传钧、侯锋，国土开发整治与规划，江苏教育出版社，1990。
8吴传钧主编，1∶100万中国土地利用图集，科学出版社，1990。
9吴传钧副主编，中国大百科全书·地理学，中国大百科全书出版社，1990。
10吴传钧，论地理科学的研究核心——人地关系地域系统，经济地理，Ⅺ1991，3：1～6。
11吴传钧、郭焕成主编，中国土地利用，1994。
12吴传钧、刘建一、甘国辉合编，现代经济地理学，江苏教育出版社，1997。
13吴传钧主编，中国经济地理，科学出版社，1998。
14吴传钧主编，人地关系与经济布局——吴传钧文集，学苑出版社，1998。
15吴传钧主编，中国农业与农村经济持续发展问题，中国环境科学出版社，2001。 他不仅经常到大学讲课，指导地理爱好者撰写论文，辅导身边的年轻同志，带助手，而且作为硕士、博士、博士后导师，从1961年起，先后为地理学输送了国土整治、经济地理、人文地理等专业的高层次中青年科技人才。这些人迅速成长起来，成为地理教育和研究的骨干和中坚。学生：陆大道。
