1、红蜘蛛
红蜘蛛常年都有，一旦感染，沃柑的叶片、果实和枝梢都会受到侵害，且这种害虫繁殖快，是目前沃柑最大的虫害。
防治方法：一般用喷洒农药的方式治理，将乙唑螨腈、阿维螺螨酯或阿维乙螨唑等兑水至2000～3000倍液使用。上林县农户种植时在沃柑树垄之间种植藿香蓟，用藿香蓟吸引红蜘蛛，减少对沃柑的侵害。这种特色留草种植方式，不但能保持土壤肥力还能减少农药使用量，在保护环境的同时，又保证了沃柑的品质。
2、溃疡病
溃疡病属于细菌性病害，随着风雨等途径传播，暴发时间不定。沃柑感染溃疡病后叶片和果实会出现病状斑点，继而掉落，严重影响果实的产量和品质。
防治方法：（1）用杀铜制剂氢氧化铜或松酯酸铜等1000～1500倍液进行防治；
（2）应在暴雨过后喷洒复方配药，若已经感染溃疡病，应将患病树枝剪去，并在新枝长出2cm时用石硫合剂、可杀得等再次防治，防治期间注意定期更换药品种类，以防产生抗药性。
3、炭疽病
炭疽病在每年4月、5月、7月、8月和9月为高暴发期，对沃柑的叶片、果实和枝梢都可造成为害，导致树梢枯萎、果实腐烂。
防治方法：炭疽、灰霉、疮痂、斑点统称真菌性病害，对此类病害应用吡唑醚菌酯、咪鲜胺或唑醚代森联1500～2000倍液进行防治。还应注意加强田间管理和通风透气。
4、黄龙病
为害特点：黄龙病是细菌性病害，在沃柑上为害极大，仅次于红蜘蛛；暴发期与木虱相同，为每年7—8月。
防治方法：防治黄龙病目前尚无有效的药物，应该以防为主，在选择树苗时就应选择健壮且无病虫害的树苗，同时加强栽培管理，用防治柑橘木虱的特效药阿立卡等噻虫嗪类药物进行预防。
5、柑橘木虱
柑橘木虱是黄龙病传播的主要途径，会影响沃柑正常生长。
防治方法：一般使用吡虫啉、啶虫脒或噻虫嗪的1500～2000倍液进行防治，其他方法参考黄龙病。