医疗器械公司往医院开户时，通常需要准备以下文件和材料：
1. 公司相关证件：包括营业执照、税务登记证、组织机构代码证等。
2. 资质证书：医疗器械经营企业需要具备相应的医疗器械经营许可证、医疗器械生产许可证等相关资质证书。
3. 产品资料：包括医疗器械产品的注册证书、产品说明书、性能和安全检验报告等。
4. 质量管理体系文件：包括ISO质量管理体系认证证书、产品质量检验报告等文件。
5. 合同和协议：可能需要提供与医院合作相关的合同、协议、委托书等。
除了这些文件和材料外，具体的开户流程和所需文件可能因地区和医院政策而有所不同。因此，建议联系目标医院的采购部门或相关单位，了解详细的开户要求和流程。