共有5点区别，目标，职能结构，知识结构，学科专业，师资力量不同
①培养目标的不同：
专科：培养具有某种专业知识和技能的中、高级人才；培养能适应在生产、管理、服务一线和广大农村工作的技术应用性人才；培养掌握一定理论知识，具有某一专门技能，能从事某一种职业或某一类工作的人才，其知识的讲授是以“能用为度”、“实用为本”。
本科：培养较扎实地掌握本门学科的基础理论，专门知识和基本技能，并具有从事科学研究工作或担负专门技术工作初步能力的高级人才。要求学生具备合理的知识结构，掌握科学工作的一般方法，能正确判断和解决实际问题，具备终生学习的能力和习惯，能适应和胜任多变的职业领域，本科教育知识的讲授不仅要向学科的纵深发展，还要注意学科间的横向关系，与此同时，本科教育注意培养学生的科学思维能力、创造能力、创新精神和创业精神。
②职能结构的不同：
专科：以教学为主要职能。
本科：以教学、科研、成果转化与产业服务为主要职能。
③知识结构的不同：
专科：横向的职业岗位知识模块，强调岗位业务知识和实践操作技能，理论以“够用”、“实用”为度。比较集中于改造认识世界的范畴，是相对完整的实践体系和相对不完整的理论体系的统一。
本科：纵向的框架式知识体系，强调课程的整合、学科的完整和综合，注重跨学科知识的迁移。比较侧重〃WHAT〃和〃WHY〃，集中于认识世界的范畴，是相对完整的理论体系和相对不完整实践体系的统一。
④学科专业的不同：
专科：以面向行业或本地区为主，专业覆盖面较窄，数量较少，社会适应性有限。继续学习的潜能较弱。
本科：以面向行业，面向大经济区域为主，专业覆盖面较宽，数量较多，社会综合适应性较强。继续学习的潜能较大。
⑤师资结构的不同：
专科：学士学位为主体，教师以教学为主要任务，对教师的评价主要依赖教学效果，〃双师型〃教师倍受青睐，有影响的学科带头人较少。
本科：硕士、博士学位占较高比例，教师既要教学也要承担科研任务，教学能力和科研能力是教师的评价主要依据，有影响的学科带头人较多。