生物工程专业考研方向主要有：生物科学、生理学、遗传学、生物技术、生物信息学、生物信息技术、生物科学与生物技术、动植物检疫、生物化学与分子生物学、医学信息学等等。考生需要根据自己的兴趣爱好和未来的发展意向选择适合自己的专业方向。
1、生物化学与分子生物学
化学与分子生物学专业主要从微观或分子的角度研究生物现象，在分子水平上探索生命的本质，研究物体的分子结构与功能，物质代谢与调控。本专业涉及物理、化学、数学、生物等学科的交叉，渗透生物其他专业，是一个基础研究专业。化学和分子生物学是目前自然科学中发展最迅速、最具活力的前沿领域。
2、微生物学
微生物学是生物学下的一个二级学科，是研究微生物及其生命活动的基本规律和应用的科学。它是在细胞、分子或群体水平上研究微生物的形态结构、生理代谢、遗传变异、生态分布、分类进化等生命活动基本规律，并应用于工业发酵、医疗卫生、生物工程、环境保护等实际领域的科学。
3、生物医学工程
医学工程是一级学科，部分高校也以两个学科的硕士学位项目招生。这门学科是工程技术向医学和生命科学渗透的结晶。涉及数学、物理、化学、生物、电子信息技术、计算机技术、激光、微波、超声波等基础学科和机械、化工等应用工程学科。其主要研究领域有:医学影像理论与技术；医学信号检测与处理技术；医疗卫生领域的信息工程；生物医学应用和物理领域的生物医学仪器，如微波、毫米波、激光和超声波等。
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