1. 原生动物门：由单细胞组成的最低等动物，代表动物有眼虫、草履虫。
2. 菱形虫门：结构简单的内寄生动物，种类较少。
3. 直泳虫门：与菱形虫相似，分类地位尚不明确。
4. 多孔动物门：又称海绵动物门，由多细胞构成，代表动物是海绵。
5. 扁盘动物门：目前仅发现丝盘虫一种，代表动物为丝盘虫。
6. 古杯动物门：已灭绝的动物，形态类似杯子。
7. 腔肠动物门：拥有水螅、水母、海葵和珊瑚等代表动物。
8. 栉水母动物门：与腔肠动物门关系密切，代表动物为栉水母。
9. 扁形动物门：包括涡虫、吸虫、绦虫等寄生虫，代表动物有涡虫。
10. 螠虫动物门：海洋底栖动物，代表动物有螠虫。
11. 舌形动物门：均为寄生虫，代表动物尚难确定。
12. 微颚动物门：1994年新发现，所知甚少，代表动物未知。
13. 纽形动物门：类似扁形动物，代表动物有纽形动物。
14. 颚胃动物门：体形小，生活于浅海细沙中，了解不多，代表动物未知。
15. 线虫动物门：包含蛔虫等多种寄生虫，代表动物为蛔虫。
16. 腹毛动物门：身体腹面长有纤毛，代表动物有腹毛动物。
17. 轮虫动物门：类似原生动物，代表动物为轮虫。
18. 线形动物门：与线虫动物类似，代表动物有线形动物。
19. 鳃曳动物门：海洋底栖动物，生活在冷水，种类极少，代表动物有鳃曳动物。
20. 动吻动物门：类似鳃曳动物，代表动物有动吻动物。
21. 棘头虫动物门：身体前端有吻，代表动物有棘头虫。
22. 铠甲动物门：1983年发现的新门，代表动物未知。
23. 内肛动物门：代表动物为苔藓状小动物。
24. 环节动物门：身体呈环节状，代表动物有蚯蚓、蚂蟥等。
25. 环口动物门：新发现的一类动物，代表动物为环口动物。
26. 星虫动物门：与螠虫动物相似，代表动物有星虫。
27. 软体动物门：常见的贝类，代表动物有软体动物。
28. 软舌螺动物门：已灭绝，代表动物为软舌螺。
29. 叶足动物门：寒武纪的奇虾等，代表动物有叶足动物。
30. 缓步动物门：抗逆性极强的动物，代表动物有缓步动物。
31. 有爪动物门：身体呈蠕虫状，足呈圆柱形，近乎灭绝，代表动物有爪动物。
32. 节肢动物门：种类繁多，包括昆虫、甲壳、多足等纲，代表动物有节肢动物。
33. 腕足动物门：留下化石的动物，代表动物有腕足动物。
34. 外肛动物门：与内肛动物曾为同一门，现已分开，代表动物有外肛动物。
35. 帚虫动物门：种类少，海洋底栖，代表动物有帚虫。
36. 古虫动物门：5.3亿年前生命大爆发中灭绝，近年才被发现，代表动物有古虫。
37. 棘皮动物门：熟悉的海星、海胆、海参等，代表动物有棘皮动物。
38. 须腕动物门：没有嘴和消化管的非寄生动物，代表动物有须腕动物。
39. 异涡动物门：仅2种，曾被认为是扁形或软体动物，代表动物有异涡动物。
40. 毛颚动物门：颤派有50种左右，代表动物有毛颚动物。
41. 半索动物门：身体呈蠕虫形，有人将其归入脊索动物门，代表动物有半索动物。
42. 脊索动物门：包括大部分脊椎动物，代表动物有脊索动物。
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