出现黑暗组织的：
与黑暗组织有关的集数：
001《云霄飞车杀人事件》
对应漫画：V1F1
播映时间：1996年01月08日
工藤新一：一名高中生侦探，凭借过人的推理能力，帮助警方破获众多大案，所以也被称为日本警察的救世主。某天，新一和自己青梅竹马的同班同学毛利兰相约到游乐场游玩时，意外的在云霄飞车上遇到了杀人事件，在新一的推理下，很快协助警方破了这个案子。不过，这时有两个黑衣人的身影进入了新一的视线……
054《电玩公司杀人事件》
对应漫画：V12F4-F6
播映时间：1997年04月14日
满天堂公司制作了名为“毛利小五郎 推理之馆”的游戏并请小五郎监制，同时邀请其参加在米花饭店召开的新作发表会。饭店里有迷样的黑衣男子，是那些家伙的同伙？柯南跟踪那个迷一样的男子时，突然发生了爆炸，迷样的男子被炸死。
128《黑暗组织10亿抢劫事件》
对应漫画：V2F7（改编）
播映时间：1998年12月14日
小五郎他们去银行，柯南看到了抢劫运钞车的强盗，强盗逃走了。然后，在河边发现了逃走的车子。有疑问的柯南去了银行职员广田雅美的家……
129《来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件》2小时特别篇
对应漫画：V18F6-V19F1
播映时间：1999年01月04日
柯南的班级转来了灰原哀。隔壁班级的一个男孩因为哥哥下落不明而来委托少年侦探团。寻找的时候发现了一个黑衣女子的身影……。那个组织的真面目到底是？然后，博士和会员和柯南去广田教授家拿软盘，可是……
176《与黑暗组织的再会（灰原篇）》
对应漫画：V24F7-F11
播映时间：2000年01月17日
柯南和哀在放学的途中看到了和琴酒的车一模一样的车……！柯南在车上放了窃听器。车子的主人果然是琴酒。窃听器被琴酒发现后毁掉了。仅仅留下了在杯户城市酒店会有什么事发生的线索。于是柯南和哀去了杯户城市酒店。
177《与黑暗组织的再会（柯南篇）》
对应漫画：V24F7-F11
播映时间：2000年01月24日
杯户城市酒店内举办的酒卷昭的怀念会上发生杀人事件。柯南找到了犯人的线索。但混杂在人群中的哀却被什么人带走了！
178《与黑暗组织的再会（解决篇）》
对应漫画：V24F7-F11
播映时间：2000年01月31日
哀恢复了原来雪莉的身体，琴酒和伏特加来到了关她的房间，她从壁炉的烟囱里想办法逃了出来……。柯南分析出了皮斯可的真面目，为救出哀于是跑向了关她的房间，那时皮斯克出现了。
230《谜一样的乘客（前篇）》
对应漫画：V29F3-F5
播映时间：2001年04月16日
客户回去后，爵士俱乐部里琴酒和伏特加正在密谈。那儿出现了伪装成服务生的贝尔摩德，贝尔摩德一副已经有坏主意的样子。
柯南他们因为去滑雪旅行，乘上了该线路的巴士，灰原也在其中。在途中靠站时，新出医生和朱迪老师也上车了，此时，灰原强烈地感觉到组织的气息。
231《谜一样的乘客（后篇）》
对应漫画：V29F3-F5
播映时间：2001年04月23日
柯南他们乘坐的巴士被强盗犯二人组劫持了。柯南推测出后排座上的三人中有强盗犯的同伙。强盗犯B通过手机联络，要求释放主犯矢岛，巴士进了首都高速。偶然看见窗外气球的柯南，头脑中闪现出了谁才是强盗犯的同伴！
286《工藤新一NY事件（事件篇）》
对应漫画：V34F11-V35F4
播映时间：2002年07月15日
高烧倒下的小兰在神志不清中想起了与新一一起去纽约的事情。
新一与小兰乘新一的母亲--有希子的爱车前往剧场的途中高速行驶，结果超速被警察逮着。而将有希子解救的是化装成纽约市拉地休警官的女演员沙朗*韦约得。
287《工藤新一NY事件（推理篇）》
对应漫画：V34F11-V35F4
播映时间：2002年07月22日
新一的母亲有希子带着15岁的小兰与新一在沙朗*韦约得的介绍下来到百老汇的幕后参观。小兰救下差点被从天花板落下的铠甲击中的女演员罗斯，罗斯似乎怕有人要她的命而胆怯万分。
舞台剧开始后，以神话为题材的音乐剧达到高潮。舞台中央吊在空中扮演天使的男演员休斯胸部遭枪击身亡。
288《工藤新一NY事件（解决篇）》
对应漫画：V34F11-V35F4
播映时间：2002年07月29日
摆在新一的母亲-有希子及15岁的小兰与新一眼前的是百老汇音乐剧的主演在舞台被杀事件。嫌疑人应该是同舞台演出的4名女演员之一。
新一在舞台装置中发现羽毛后向着事件的真相迈进。有希子听过新一的推理后，在舞台开始解迷秀，将犯人推向绝境。
307《没有留下声音的证据（前篇）》
对应漫画：V37F5-F7
播映时间：2003年01月27日
3名委托人造访毛利侦探事务所。说是寻找失踪了的有名的软件工程师·板仓。3人分别是各自游戏公司的职员，委托板仓开发不同的软件。小五郎从发送给3人的图象来到旅馆的房间。但是与委托人一起进入房间的时候，板仓却已死亡。
308《没有留下声音的证据（后篇）》
对应漫画：7F5-F7
播映时间：2003年02月03日
小五郎受委托调查游戏软件工程师板仓死亡。目暮警官断定是心脏病发作的杀人事件。小五郎怀疑三名委托人是嫌疑犯，但没有证据。柯南为了得到记录着黑色组织线索的被害者日记磁片，急于解决事件。
309《与黑色组织接触（交涉篇）》
对应漫画：V37F8-V38F1
播映时间：2003年02月10日
柯南得到与黑色组织有关的软件工程师板仓的日记磁片，去阿笠博士家用电脑打开日记。 日记中详细记录了黑色组织与板仓的接触经过。板仓屈服于组织的威胁，同意卖出开发中的系统软件。了解交货期限将至的柯南决定代替板仓参加交易。
310《与黑色组织接触（追击篇）》
对应漫画：V37F8-V38F1
播映时间：2003年02月17日
扮做被杀的板仓与黑色组织交易软件的柯南打开mail，接到VODKA怀疑的电话。使用变声器的柯南和其约好4小时后在东京进行交易。想在对手知道板仓死亡的消息前接触。但是，在急速赶往东京的途中，车子爆胎。
311《与黑色组织接触（决死篇）》
对应漫画：V37F8-V38F1
播映时间：2003年02月24日
柯南为与黑色组织交涉而搭便车急忙赶往东京，而那辆车是逃走的宝石强盗犯的车。接近目的地，柯南用麻醉枪与新兵器射出球的皮带把宝石强盗犯关在车中。之后的事情拜托阿笠博士，柯南一人前去交易。
340《隐藏在厕所里的秘密（前篇）》
对应漫画：V41F10-V42F1
播映时间：2003年11月03日
柯南、哀、阿笠博士去拜访了哀父亲宫野博士的朋友的事务所。他们认为他可能多少知道一点黑暗组织的以及哀父亲的行踪。但是宫野博士的朋友出岛也已经30多年没和宫野博士碰头了。但是了解到了一点，就是最近宫野博士女儿、明美曾来过...
341《隐藏在厕所里的秘密（后篇）》
对应漫画：V41F10-V42F1
播映时间：2003年11月10日
阿笠博士带着柯南和哀拜访了哀父亲的儿时的玩伴出岛。但是出岛不知道被谁用毒药毒死了。哀担心是不是暗黑组织做的但柯南予以否定。并推理出罪犯是在出岛的设计办事处工作的设计员。
345《与黑衣组织直面对决 满月之夜的双重迷案》2小时特别篇
对应漫画：V42F5-F10
播映时间：2004年01月05日
兰收到暗示有杀人预告的万圣节晚会邀请函的小五郎和园子两个人去了晚会会场。另一方面、新一同样收到了一份一样的邀请函。而且新一和柯南是同一个人也渐渐暴露了。柯南用麻醉枪让拼命阻止他的哀睡着了。在幽灵船会场上扮成亡灵船长的举办人是某游戏开始了。但是发生了举办者被杀事件。与此同时、朱笛出现在被一个人留在家里的哀的面前
425 黑色的冲击！黑色组织魔爪伸来的瞬间
对应漫画：48F9-49F4
播映时间：2006年1月9日
小五郎在与播音员水无怜奈的对话中得知她被恶作剧的门铃所困扰一事，便与柯南及兰一同前往怜奈的家。
小五郎等人虽然抓到了犯人,但此时，柯南却从安装的窃听器中觉察到怜奈实际是黑色组织同党一事。
随后，黑色组织制定了于下午1点在edayP暗杀一个代号为DJ的人的计划。密切关注着怜奈的FBI探员朱蒂决定联手柯南，为了阻止暗杀计划，就要知道ADP和DJ的意思是什么，随即展开了推理…。
有关警视厅恋爱物语的：
146《本厅刑事的恋爱物语（前篇）》
对应漫画：V21F8-F10
播映时间：1999年05月24日
简介：作为青色古堡的探险事件的参考人，博士和少年侦探团被叫到了警视厅。随后2亿元抢劫事件的受害人东都银行的增尾行长也来了。增尾给在家的妻子打电话时，电话的那头传来了惨叫声。马上赶到增尾家时发现增尾的妻子已经被杀害了。
147《本厅刑事的恋爱物语（后篇）》
对应漫画：V21F8-F10
播映时间：1999年05月31日
简介：增尾的妻子是被什么人从背后刺中而死亡的增尾的妻子。柯南却从中发现了疑点。然后分析出了杀害的方法。另一方面喜欢佐藤警官的高木警官却想到了其他的事情……
156《本厅刑事的恋爱物语2（前篇）》
对应漫画：V23F10-V24F2
播映时间：1999年08月09日
简介：佐藤警官和高木警官在押送嫌疑人的时候被犯人逃走了。好容易追上犯人时佐藤警官铐错了手铐，被留在了美术馆的厕所里。于是高木警官和少年侦探团为找出真正的犯人开始了秘密调查。
157《本厅刑事的恋爱物语2（后篇）》
对应漫画：V23F10-V24F2
播映时间：1999年08月16日
简介：就在高木警官和侦探团在搜查犯人时，佐藤警官和嫌疑犯所在的美术馆竟要用博士发明的炸药爆破拆除掉，此时距离爆破的时间不到几分钟了……
205《本厅刑事恋爱物语3（前篇）》
对应漫画：V27F4-F6
播映时间：2000年08月28日
简介：都内发生连续放火事件，因为步美目击到十分类似于犯人的可疑人物，高木警官他们一同到现场进行仔细的检查。而第二天是佐藤警官父亲的忌日，佐藤警官父亲殉职的事情在警界被称为“愁思郎事件”。恍然大悟了“愁思郎事件”中佐藤警官父亲最后遗言含义的高木警官却被什么人袭击了。
206《本厅刑事恋爱物语 3（后篇）》
对应漫画：V27F4-F6
播映时间：2000年09月04日
简介：灰原推测出了纵火犯下次放火的地点，紧接着纵火犯出现。。。。。。步美、光彦、元太因此跟踪纵火犯。解开了“愁思郎事件”之谜的佐藤警官来到了18年前犯人的住所。被困在火焰中的高木警官终于安全脱险。
253《本厅刑事恋爱物语4（前篇）》
对应漫画：V32F11-V33F2
播映时间：2001年10月15日
简介：柯南与小兰及园子正巧遇见佐藤警察的同事由美，从而得知佐藤相亲一事。在园子的逼迫下来到相亲地点。不料佐藤相亲的对象竟是白鸟警部。如果在日落前高木不能赶来的话两人就决定结婚。能救出佐藤的高木却在此时遇上了抢匪，艰难的开始搜查。
254《本厅刑事恋爱物语4（后篇）》
对应漫画：V32F11-V33F2
播映时间：2001年10月22日
简介：巧遇上新出老师的三人继续关注事态发展。而以日落前为约定的誓言之吻让大家更提高木担心。在柯南的帮助下，高木推理出了犯人。但在追捕犯人之后，日落的时间……
358《本厅刑事恋爱故事5（前篇）》
对应漫画：V44F4-F6
播映时间：2004年05月03日
简介：佐藤警官和高木警官去海滨公元约会。那天、高木警官决定要向她告白就把戒指放在了包里。但是公园内有数十位佐藤追求者的刑警对2人进行监视。不久两人碰巧碰到了柯南一行人他们就照看起了小孩子。然而原本应该有戒指的包中却变成了毒品……
359《本厅刑事恋爱故事5(后编)》
对应漫画：V44F4-F6
播映时间：2004年05月10日
简介：高木警官和佐藤警官的美好的约会、因为拿错的高木警官的包里有毒品、突然变成了搜查毒品交易事件了。公园内高木警官他们和途中遇到的柯南推理出这个包的犯毒者是一个惯用右手的带帽子的男人。不久柯南他们就发现了这个犯毒者却…
390《本厅刑事恋爱物语6（前篇）》
对应漫画： V44F4-F6
播映时间：2005年02月28日
简介：高级公寓的23楼发现了被人杀害的男性尸体。随后赶往现场的高木与佐藤警官、长警官开始了搜查。同时，高木听放学归来的柯南说早上曾见过有可疑的人影。不久后即证明那男子是受害人的同事。可那男子却寄食（吃闲饭）在千叶警官家里…
391《本厅刑事恋爱物语6（后篇）》
对应漫画：V44F4-F6
播映时间：2005年03月07日
简介：男性公司职员被刺死事件中，柯南一行人偶然在死亡推断时间看到了一名有嫌疑的男子。当获知这名男子是受害者的同事时，立刻，前往那名男子的住所，然而他怎么在千叶刑警的住所寄食。而且在死亡推断时间时，有他和千叶在一起看电视的证言。在居室中什么也没有发现的柯南对挂钟产生了怀疑…
431 本厅刑警的恋爱物语7（前篇）
对应漫画：50F1-F4
播映时间：2006年2月20日
小五郎、柯南、兰在餐厅里偶遇来参加联谊会的千叶刑警与高木刑警。而且交通科的宫本由美与佐藤刑警也来了。
联谊会上，主办者江本将史的姐姐彩说很担心5岁的表弟浩太一人在家而要回家去。因为2星期前家里发生过怪事。于是，柯南、佐藤等人便一同前往了彩的住所。然而浩太却不在家里。浩太被人绑架了…。
432 本厅刑警的恋爱物语7（后篇）
对应漫画：VOl50F1-F4
播映时间：2006年2月27日
浩太被绑架了，犯人索要100万日元赎金。柯南推理认为是缺席了联谊会的六田卓子，引屋门成，佐冢良兼中的某人伪装后绑架了浩太。
线索是3月26日，浩太去那名男子家的时候观看了棒球比赛的转播。根据彩的描述，当时浩太认为那是一场无聊的比赛。佐藤考虑如果能够知道是哪场比赛，再与将史的接打电话的时间进行核对的话，是可以追查出犯人的…。
参考资料：www.aptx.cn