获得2000年度国家最高科学技术奖的是吴文俊、袁隆平两位院士。吴文俊在代数拓扑学领域的奠基性工作，半个世纪以来对国际数学领域的发展一直产生着广泛而积极的影响。他运用计算机进行数学定理证明和非线性方程组求解，彻底改变了数学机械化领域的面貌，为信息时代数学发展开辟了新途径。袁隆平突破经典遗传理论的禁区，提出水稻杂交新理论，实现了水稻育种的历史性突破。现在我国杂交水稻的优良品种已占全国水稻种植面积的50％，平均增产20％。
王选和黄昆院士是2001年度国家最高科学技术奖得主。王选长期致力于文字、图形和图像的计算机处理研究，应用自己的发明成果开发汉字激光照排系统并形成产业，取代沿用了上百年的铅字印刷，推动了我国报业和出版业的跨越式发展，创造了巨大的经济和社会效益。黄昆在固体物理学研究方面做出了许多开拓性的重大贡献，对推动固体物理学的发展起了重要作用。
2002年度国家最高科学技术奖的得主只有一位院士——金怡濂，他是我国计算机事业的开拓者之一，主持完成了我国多台大型、巨型计算机的研制，系统和创造性地提出了巨型机体系结构、设计思想和实现方案，为我国计算机事业特别是巨型计算机的跨越式发展做出了重大贡献。
2003年度的国家最高科学技术奖由中国科学院院士刘东生和中国工程院院士王永志获得
2004年空缺
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参考资料：http://www.173838.com/Article/bkzs/zs/200511/219.html