机票燃油附加费是可以抵扣进项税的。
根据《关于深化增值税改革有关政策的公告》:
第六条、纳税人购进国内旅客运输服务，其进项税额允许从销项税额中抵扣。
（一）纳税人未取得增值税专用发票的，暂按照以下规定确定进项税额：
1、取得增值税电子普通发票的，为发票上注明的税额；
2、取得注明旅客身份信息的航空运输电子客票行程单的，为按照下列公式计算进项税额：
航空旅客运输进项税额=(票价+燃油附加费)÷(1+9%)×9%，
3、取得注明旅客身份信息的铁路车票的，为按照下列公式计算的进项税额：铁路旅客运输进项税额=票面金额÷(1+9%)×9%
4、取得注明旅客身份信息的公路、水路等其他客票的，按照下列公式计算进项税额：
公路、水路等其他旅客运输进项税额=票面金额÷(1+3%)×3%。