修改论文中参考文献的序号可以采用以下两种方法：
方法一：
【1】在菜单栏选择“开始”——>“段落”的“编号库”的“定义新编号格式”。
【2】点击“确定”按钮。
【3】用鼠标选中全部的参考文献，点击刚才新建的编号格式。
【4】将光标放在需要插入参考文献引用的位置，在菜单栏的“引用”的“题注”的“交叉引用”，选择参考文献的序号，点击“插入”，再点击“关闭”即可。
方法二：
【1】在需要插入参考文献引用的位置输入“[1]”（注：[]内的内容不输入），选中“[1]”，点击菜单栏中的“插入”——>“交叉引用”——>选择需要插入的文献——>点击“插入”——>点击“关闭”。
【2】在文中其他位置输入需要插入的参考文献对应序号，重复步骤1。