标记基因和目的基因是连在一起的。
用标记基因筛选基因载体的方法很简单，在表达载体上一般有两个甚至两个以上的标记基因，比如，一个是抗
青霉素的基因，一个是抗
四环素的基因，将目的基因插入到抗四环素的基因中，那这个表达载体就不能表达出抗四环素的性状了，只能表达出抗青霉素的性状。然后，将表达载体放在含青霉素的
培养基上培养，那么，凡是含有表达载体的就能存活下来。
然后将这些能抗抗青霉素的菌落放在含四环素的培养基上，不能存活下来的就是我们所需要的。
具体方法是印章法。也就是用一块无菌的增绒布，在含青霉素的培养上印一下，接种到含四环素的培养上，如果那个菌落不能生长，那就是我们所需要的，然后从含青霉素的培养基中选择。