游戏中一共有4个结局。具体得看玩家会选择如何对待最后的boss了，是杀掉还是关起来。通常玩家都是误杀梅森打了头部，结尾杀了BOSS，结局的最后是小梅森和伍兹来一起击败梅森的故事.
1、误杀梅森打头，最后一关杀boss，最后结局是小梅森和伍兹祭拜梅森
2、误杀梅森打头，最后一关不杀boss，结局是boss越狱杀了伍兹后自杀
3、误杀梅森打腿，最后一关杀boss，最完美的结局，小梅森老梅森伍兹大团圆
4、误杀梅森打腿，最后一关不杀boss，小梅森和老梅森是团圆了，但伍兹被越狱的boss弄死了
还有第五个结局
1、阿富汗回忆关卡中，抓获克里夫琴科之后，狂按F键，制止杀死克里夫琴科的冲动，直到WOODS审问完毕，WOODS会开枪杀死克里夫琴科。
2、开曼群岛，舞厅里的妹子一定要赶在其被白发老头押上飞机前救出，并且击毙白发老头。(如果失败则开启指挥任务:第二次机会，一定要成功完成救出妹子)
3、回忆关卡，抓捕诺列加关，射击老梅森的双脚，千万不能爆头。
4、所有4个可选指挥关卡完成，并且在最后一个指挥关卡杀死赵天，导致SDC解散，天（）结束和美国的军事对抗。
5、这个最最关键，很多人会选错的——那就是在卧底关卡，当小梅森的基友被抓住后，卧底不要为了救他而牺牲自己，而是直接击杀基友，获得BOSS的信任。
6、个不是选择，而是会发生的改变，在航母遇袭关卡，本来会被杀死的妹子会被卧底保护，卧底将飞身扑救挡子弹，妹子被打晕但苏醒，之后妹子会破解航母的控制系统。同时玩家控制BOSS时不要杀死黑人指挥官。接着红五星标志的中（）无人机出现，击落了投弹的无人机，航母没有沉没。
7、天（）领导人将和美国总统通话，这是将不是怒斥对方，而是和蔼的说出中文的"谢谢"。
8、最后一关，不杀死BOSS，而是将其押上飞机。
最终结局，妹子将上电视接受采访，BOSS的入侵病毒被完全清除，BOSS无法越狱，在狱中用头撞电视机，撞得头破血流，老梅森出现，和WOODS ，小梅森成功团聚，天（）和美帝携手迈进和平的新时代。
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