同所有药物一样，疫苗对人体而言毕竟是一种异物，绝大多数健康人接种后不发生任何不良反应，只有极少数因个体差异在接种后发生不良反应，百白破疫苗也是如此。少数人接种百白破疫苗后可能会发生不良反应。
(1)常见不良反应：在注射部位可出现疼痛和触痛，多数情况下于2～3天内自行消失;出现一过性发热反应，其中大多数为轻度发热反应，一般持续1～2天后自行缓解;少数儿童可能出现一过性皮疹，一般不超过2天可自行缓解。
(2)罕见不良反应：重度发热反应。
(3)极罕见不良反应：过敏性皮疹，一般接种疫苗后72小时内出现。
如果孩子接种后，出现发热在37.1℃～37.5℃时(腋温)，应加强观察，适当休息，多饮水，防止继发其它疾病;当发热超过37.5℃，或37.5℃以下并伴有其它全身症状、异常哭闹等情况，应及时到医院诊治;对于红肿直径小于1.5厘米的局部反应，一般不需任何处理;对于红肿直径1.5厘米至3厘米的局部反应，可用干净的毛巾热敷，每日数次，每次10～15分钟;对于红肿直径大于3厘米的局部反应，应及时到医院就诊。
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