危害番石榴的病害主要有日灼病、叶枯病、果腐病、假尾孢褐斑病、根结线虫病以及炭疽病等。
1、假尾孢褐斑病
发病症状：番石榴的果实和叶子均会受到该病危害。叶子感病时，叶片上出现没有明显边缘的红褐色、暗褐色病斑，形状不规则，叶子背面有灰色霉菌物；果实感病时，病斑由暗褐色的小点逐渐变为黑色小点，边缘为红褐色，中央凹陷，潮湿时会出现霉状物。
防治方法。发现番石榴出现病叶时，需要及时摘叶并进行集中烧毁或深埋；日常管理中可以适时对叶子进行修剪，降低假尾孢褐斑病的发生概率。发病初期，及时喷洒60.0%锰锌·多菌灵可湿性粉剂600倍液进行防治。
2、日灼病
症状：果实的向阳面多会受到危害，病害初发时果面会出现水渍状小点，之后扩展为黄褐色、红褐色病斑，病斑凹于果面，多个病斑会融合成大的黑褐色病斑。日灼病是复合侵染的一种病害，向阳面的果实先发生日灼伤，之后病原菌入侵。
防治：常见的物理防治方法有适当修剪以减少病枝；在果实附近留叶起到遮挡作用，避免日光灼伤果实；增施有机肥，改良土壤，提高土壤的供肥能力，增强番石榴树的抗病力；坐果后及时套袋，套袋时避免对果实造成伤口，且套袋前需要喷洒保护性杀菌剂。化学防治方法是在发病初期及时喷洒75.0%百菌清可湿性粉剂800倍液或50.0%腐霉利可湿性粉剂1 000倍液。
3、炭疽病
症状：叶子染病时，会产生黄褐色、不规则或近圆形病斑，病斑边缘颜色相对较深，部分病斑会在叶尖、叶缘发生，严重时会扩张到半个叶子，后期病斑上会有黑色小点，且中间颜色为灰白色。枝梢染病时，初期为褐色病斑，之后从病枝开始由上到下逐渐变为灰白色、枯死。果实染病时，果面上会出现近圆形或圆形病斑，中间凹陷，病斑上会出现由粉红色变成橘红色的小点，果实染病后会形成干果，然后脱落。
防治方法：首先，选择抗病品种。其次，在发病初期，可交替喷施75.0%百菌清+70.0%托布津1 000～1 500倍液、30.0%氧氯化铜+75.0%百菌清800～1 000倍液、40.0%三唑酮·多菌灵可湿粉1 000倍液等，连续喷施三四次，视天气和病情隔10～15天喷1次。
