目前南京共有四所军事院校，分别是中国人民解放军陆军指挥学院，中国人民解放军海军指挥学院，中国人民解放军陆军工程大学，中国人民解放军南京政治学院。
一、中国人民解放军陆军指挥学院
中国人民解放军陆军指挥学院，位于江苏省南京市，是2017年6月29日，国防部公布的调整改革后军队院校共43所的名单之一。
学院共拥有5个军事学博士学位授权一级学科（战略学、战术学、军队指挥学、军队政治工作学、军事训练学），8个军事学硕士学位授权一级学科（军事思想及军事历史、战略学、战役学、战术学、军队指挥学、军事管理学、军队政治工作学、军事训练学），2个军事硕士专业学位授权领域。
二、中国人民解放军海军指挥学院
中国人民解放军海军指挥学院是海军最高学府，担负培养海军中高级指挥人才任务。学院地处人杰地灵的古都南京市区，营院环境优美，交通便利；师资力量大，教学设施先进。
学院自86年开办研究生教育以来，2020年已拥有10个硕士学位授权专业，3个博士学位授权专业，具有组织硕士研究生入学单独考试权，主要担负培养海军中高级指挥干部、海军军以上机关参谋及军事学硕士、博士研究生的任务，学院坐落在南京市，占地面积48万多平方米。
三、中国人民解放军陆军工程大学
中国人民解放军陆军工程大学校本部座落于南京市，另设石家庄校区、通信士官学校（重庆）、军械士官学校（武汉）和训练基地（徐州）；占地11422亩，建有教室679间、各类实验室（专修室）684个、游泳池（馆）10个、标准田径运动场14个、室内综合训练馆（含地下靶场）8个，图书馆总面积5万平方米，开办了48个本科专业。
四、中国人民解放军南京政治学院
中国人民解放军南京政治学院，是隶属原总政治部领导的任职教育院校，正军级建制，是全军院校教学优秀单位、军队“2110工程”重点建设院校、全军研究生培养单位重点建设院校。
中国人民解放军南京政治学院前身为1977年12月成立的中国人民解放军南京政治学校；1986年6月，改称中国人民解放军南京政治学院；1999年5月，空军政治学院转隶并入南京政治学院。
以上内容参考：百度百科——中国人民解放军陆军指挥学院