在2015年，盒马生鲜在阿里巴巴集团内部得到孵化，创始人兼CEO为侯毅，原京东物流负责人。2016年1月，盒马首家店上海金桥店盒马生鲜正式开业，目前每天平均营业额可达100万元左右，已经实现单店盈利。
由于阿里系的一部分原因，下单购物需要下载盒马App，只支持支付宝付款，不接受现金、银行卡等任何其他支付方式。另外一方面则是数据敏感性，在强推支付宝支付背后，是盒马生鲜对用户消费行为大数据进行挖掘和分析。阿里巴巴为盒马鲜生的消费者提供会员服务，用户可以使用淘宝或支付宝账户注册，以便消费者从最近的商店查看和购买商品。盒马未来可以跟踪消费者购买行为，借助大数据做出个性化的建议。
盒马鲜生作为当前时代下新零售的代表，集“生鲜超市+餐饮体验+线上业务仓储及配送为一体的的线上线下经营模式，也就是所谓的：盒马是超市，是餐饮店，也是菜市场。
不过阿里巴巴也表示，创造盒马，不是单单为了要在线下开店（毕竟中国并不缺海鲜卖场），而是希望通过线上驱动淘系消费数据能力，线下布局盒马与银泰商业，以及和百联、三江购物等开展更丰富的合作形式。模式跑通后，其数据能力和技术能力将会对合作伙伴开放共享。