反诈中心通知限制非柜面交易可能不会直接影响房贷的自动扣除，但是银行可能会根据反诈中心的通知，对账户进行相应的管控措施，例如暂停或限制账户的部分交易功能，以确保账户安全。
如果您的房贷是通过银行直接从您的账户中自动扣除的，那么限制非柜面交易可能不会直接影响您的房贷扣款。但是，如果您的账户被暂停或限制了部分交易功能，可能会导致银行无法正常从您的账户中扣款，从而影响您的房贷还款。
因此，建议您及时联系银行或房贷部门，了解相关的账户管控措施以及如何进行还款，以避免因账户限制而导致逾期还款或产生其他不必要的麻烦。