南京农业大学毕业的名人校友主要有：
1、张德慈：农学家、环境科学家、生物学家、植物遗传学大师。台湾“中央研究院”院士、第三世界科学院院士。1999年，曾获世界环境科学领域最高奖——泰勒环境成就奖，是首位获得该奖的中国人。
2、李景均：遗传学家、生物统计学家，被誉为“人类遗传学的开拓者”。
3、马保之：著名农学家。1949年到台湾，任中国农村复兴委员会植物生产组组长，1954年任台湾大学农学院院长。
4、陈桢：著名动物学家、遗传学家，教育家。中国动物遗传学的创始人和动物行为学、生物学史研究的开拓者。
5、戴芳澜：著名的真菌学家和植物病理学家，中央研究院院士，中国科学院院士。
6、戴松恩：著名作物育种和细胞遗传学家，1955年被选聘为中国科学院学部委员。
7、钱崇澍：著名植物学家，教育家，中国近代植物学的奠基人与开拓者之一，中国植物分类学、植物生理学、地植物学、植物区系学的创始人之一。
8、裘维蕃：中国植物保护学会副理事长，中国植物病理学会第二届副理事长、第三届理事长，国际植物病理学会第四届理事，中国科学院生物学部委员，在植物病理学方面有杰出贡献。
9、秦仁昌：中国现代著名植物学家，中国蕨类植物学的奠基人，中国植物学的一位拓荒者，著名的蕨类学家、植物分类学家，中国科学院院士。
10、俞大绂：著名植物病理学家，农业微生物学家和农业教育家。中国植物病理学科奠基人之一，在我国最早从事植物病毒病和细菌病害的研究；首先报道小麦秆黑粉菌生理分化性；并开创了植物抗病育种工作。
11、黄宗道：土壤农业化学家，著名橡胶栽培专家，中国工程院院士，我国研究天然橡胶栽培的主要奠基人。
12、金善宝：著名作物遗传育种专家、农业教育家、中国现代小麦科学主要奠基人。1934年编著了中国第一部小麦专著《实用小麦论》，1955年当选为中国科学院院士。
13、陈俊愉：园林学家、园艺教育家、花卉专家。中国园艺学会副理事长，中国花协梅花蜡梅分会会长及梅国际登录权威（IRA），享受政府特殊津贴，中国工程院资深院士。
14、樊庆笙：著名农业微生物学家，农业教育家，中国农业微生物学的开创者之一。
15、庄巧生：中国科学院院士，作物遗传育种学家，中国农业科学院作物科学研究所研究员。
16、刘大钧：作物遗传育种学家和农业教育家。1999年当选为中国工程院院士。
17、任继周：中国工程院院士，草业科学家。长期从事草地研究，他创立了草原的气候—土地—植被综合顺序分类法，成功地应用于中国主要的牧业省（区）。
18、盖钧镒：作物遗传育种学家。主要从事大豆遗传育种和数量遗传研究，发表论著430余篇册，并致力于国家大豆改良中心的创建。 2001年当选为中国工程院院士。
19、蒋亦元：农业工程学家，教育家，农业机械专家，中国工程院院士。创造性地进行谷物割前脱粒收获机的研究，并率先取得成功，推动了中国谷物收获机的创新和发展。
20、蔡道基：中国工程院院士，环境毒理学专家。国家环境保护总局南京环境科学研究所研究员，兼任土壤与农业可持续发展国家重点实验室、“国家环境保护农药环境安全评价与污染控制”重点实验室、“江苏省有机毒物污染控制与资源化工程技术研究中心”等三个实验室的学术委员会主任。
21、万建民：作物遗传育种专家，中国农业科学院一级岗位杰出人才，2015年12月当选中国工程院院士。
22、张林秀：中国科学院农业政策研究中心副主任、中国科学院地理科学与资源研究所创新基地首席研究员，2015年当选发展中国家科学院院士。
