高考日语可以报医学类，在高考填报志愿这一步不会有阻碍。
难的是题主问的那样，医学在大学入学后很大概率还是要学英语的，因为医学术语、学术研究、器材使用等方面，还是英语最为实用。
但也不是所有医学生英语都是很好的，够用即可。学习过程中就是要能过考试，实际工作过程中，就是要能看懂自己领域内相关文章。
高校录取的步骤：
1、投档，即把符合该院校招生分数条件的考生的电子档案投递到该院校。
2、拟录取，即院校觉得考生符合录取要求，准备录取。
3、录取，把符合录取条件的考生录取到该院校，既代表已经录取。
4、退档，省级招生办投档的比例是1：1.1，部分院校为1：1.2，即院校招生计划假如为100人，投档的比例则为110人。那么就会有10个人不能录取，它的档案会被退回到省招生办公室。
高考日语是可以报考医学类的，但是医学类的学校大学公共课基本都是以英语为第一外语教学，所以大学是需要重新学习英语的。附上几所医学类的学校招生简章给你参考：
首都医科大学
《首都医科大学本科、高职(专科)2021年招生章程》第四章 录取规则第十五条 专业录取的特殊要求和限制条件：
语种要求：鉴于我校教学过程中有中英文双语教学，建议非英语语种的考生不要报考我校，凡非英语语种的考生入学后须改学英语。“5+3”一体化和“首医阶平班”部分专业课程英文授课，原则上非英语语种的考生不要报考。
北京中医药大学
《北京中医药大学2021年本科招生章程》第四章 录取规则第二十一条
根据学校专业培养需要，中医学（五年制专业除外）、中药学、公共管理类、药事管理、大数据管理与应用、英语、护理学等专业部分课程采用英语或中英双语授课，建议非英语考生慎重报考。
天津医科大学
《天津医科大学2021年普通本科招生章程》第四章 录取原则第十五条
学校专业教学培养使用的外语语种为英语,小语种考生慎重填报。
天津中医药大学
《天津中医药大学2021年普通本科招生章程》第四章 录取规则第十七条
学校各专业的公共外语课程均为英语，小语种考生慎重填报。
山西医科大学
《山西医科大学2021年本科招生章程》第五章 录取规则第十九条
学校只提供英语语种教学，建议非英语语种考生谨慎报考。凡非英语语种考生入学后须改学英语。其中临床医学（“5+3”一体化）专业（含儿科学方向）只招收英语语种考生。
南京中医药大学
《南京中医药大学2021年全日制普通本科招生章程》第四章 报考条件第十四条
学校不限考生应试外语语种，但考生进校后均以英语为第一外语安排教学。
广州医科大学
《广州医科大学2021年夏季普通高考招生章程》第五章 录取规则第二十三条
学校公共外语教学为英语，非英语语种考生需慎重报考。
广州中医药大学
《广州中医药大学2021年夏季高考招生章程》第五章 录取规则第二十五条
学校公共外语教学为英语，非英语语种考生需慎重报考。
重庆医科大学
《重庆医科大学2021年普通高等教育招生章程》二、录取原则 7.我校英语专业、临床医学（中外合作办学）只招收英语语种考生，其它专业不限外语应试语种，但新生入学后，外语教学为英语。我校所有专业男女生比例不限（法医学专业主要就业方向为公检法机构，相关性别要求请参考公招条件）；部分专业用人单位对身高有一定要求，请考生自行了解。
川北医学院
《川北医学院2021年普通本专科招生章程》第四章 录取规则第十四条
除英语专业外，我校不限制考生应试外语语种，但考生进校后均以英语为第一外语安排教学。
西南医科大学
《西南医科大学2021年全日制普通本专科招生章程》第五章 录取规则第二十一条
除英语专业外，学校招生专业不限制考生应试语种，新生进校后均以英语为第一外语安排教学，非英语语种考生需慎重报考。报考基础医学专业的考生，英语单科成绩要求不低于100分（总分150分制）；报考英语专业的考生，英语单科成绩要求不低于120分（总分150分制）。
成都中医药大学
《2021年成都中医药大学普通本专科招生章程》三、专业录取的特殊要求和限制条件第2条
英语专业只招收英语语种考生。
资料来源：网页链接
难的是题主问的那样，医学在大学入学后很大概率还是要学英语的，因为医学术语、学术研究、器材使用等方面，还是英语最为实用。
但也不是所有医学生英语都是很好的，够用即可。学习过程中就是要能过考试，实际工作过程中，就是要能看懂自己领域内相关文章。