论文查重要一般不把参考文献放进去。
要查重论文，就需要借助专业的论文查重系统进行检测，查重系统主要是将大家上传的论文与系统中的数据库资源进行比对，检测出是哪些内容有重复，从而计算出论文的整体重复率。
一般情况下，论文中的参考文献是不会查重的，论文上传到查重系统之后，查重系统是会自动识别出论文中的参考文献的，不参与正文检测。不会将其计算进重复率，当然，系统自动识别出参考文献的前提是论文的格式都是正确的，可以使论文检测系统能够自动识别出来;如果格式不正确，系统可能自动识别不出，从而导致最后的查重结果不太准确。
所以有些人在查重检测时，发现自己的论文查重报告中参考文献部分被标记成红色，也就是被检测出为重复内容，这就是因为大家提交的论文存在着参考文献设置不规范、脚注非自动插入、参考文献格式错误等问题。
这表示论文存在较多不规范的地方，从而导致检测时这些地方出现重复，所以大家一定要按照规范正确的论文格式进行撰写。
论文查重检测不包括参考文献的原因
1、因为论文内容相似度很高等问题，参考文献正常是不参与查重检测的。参考文献是不在查重范围内的，但论文重复率过高的百分比是多少，这个是没有一定的规则，每个期刊和学校对论文重复率的要求标准都是有所不同的，也许根据领域和论文内容的性质是有所改变的。
2、学校一般是不要求论文参考文献进行查重检测的，而且论文查重软件是可以识别正确的目录和参考文献进行剔除的，从而不参与正文内容的查重。但我们也是要把整篇论文内容上传到论文查重网站上，这样检测出的重复率才是最准确的。
查重系统在计算论文重复率时，会先将上传的论文与系统中的数据库资源进行比对，检测出哪些内容有重复。而参考文献通常是指引用的国内外学术文献，这些文献通常不会包含在查重系统中，因此不会被计算进重复率中。
不过需要注意的是，如果论文中引用的参考文献被检测系统认为是重复的内容，那么可能会被计算进重复率中。因此，在引用参考文献时，需要注意准确性，并尽可能用自己的话复述原文，避免被检测系统认为是重复内容。
同时，需要注意的是，不同的查重系统可能对参考文献的处理方式不同，有些系统可能会将参考文献算进重复率中，而有些系统则不会。因此，在选择查重系统时，需要选择一个可靠的、权威的查重系统进行论文查重。
论文查重是指通过特定的软件或系统，对提交的论文进行相似度分析和重复率检测，以判断论文是否存在学术不端行为，特别是抄袭或剽窃他人成果的行为。这一过程对于保证学术诚信和提高学术质量具有重要意义。
然而，关于论文查重是否包括参考文献查重这一问题，学术界存在不同的看法和实践。一些学术期刊和论文发布平台认为参考文献属于常用信息，不应计入查重范围。因为参考文献通常是引用他人的研究成果，而引用并不等同于抄袭。而另一些机构则认为参考文献同样应该纳入查重范围，因为即使是引用也需要遵循一定的规范和引用方式，不得滥用引用权。
关于查重系统，目前已经有很多商业化软件和在线平台可供选择。这些系统一般基于先进的文本比较算法，能够自动分析、对比和检测论文中的相似度。此外，一些系统还提供附加功能，如语法检测、格式规范检查等，帮助学生进一步改善论文的质量。
在我国，学术界和教育机构对于论文查重的要求日益严格。研究生在撰写毕业论文时，除了注重研究内容和创新性外，还需时刻注意学术规范和论文查重的要求。
总之，论文查重在研究生教育中扮演着重要的角色，其目的在于维护学术道德和保证学术质量。虽然对于是否包括参考文献查重存在争议，但查重系统的使用已经成为研究生撰写论文的常规操作。未来，我们希望能够进一步完善查重系统，提高其准确性和全面性，为学术界提供更强有力的学术支持。