法律分析：公积金贷款初审和复审最大的区别在于两次审核的主体机构是不一样的。公积金初审一般是由银行进行审核的，公积金复审是由公积金管理中心进行审核的。
在申请公积金贷款的时候，申请人向银行提出申请并提交公积金贷款的相关资料给银行，包括公积金缴存证明等资料，由银行进行审核;等到银行审核通过之后，再将资料上报至公积金管理中，由公积金管理中心进行复审，复审通过后公积金管理中心就会通知银行，最后银行放款。
法律依据：《住房公积金管理条例》
第十八条 职工和单位住房公积金的缴存比例均不得低于职工上一年度月平均工资的5%；有条件的城市，可以适当提高缴存比例。具体缴存比例由住房公积金管理委员会拟订，经本级人民政府审核后，报省、自治区、直辖市人民政府批准。
第三十二条 住房公积金管理中心编制的住房公积金年度预算、决算，应当经财政部门审核后，提交住房公积金管理委员会审议。
住房公积金管理中心应当每年定期向财政部门和住房公积金管理委员会报送财务报告，并将财务报告向社会公布。