一、机构性质不同
中国科学院为中国自然科学最高学术机构、科学技术最高咨询机构、自然科学与高技术综合研究发展中心。是国家在科学技术方面的最高咨询机构。负责对国家科学技术发展规划、计划和重大科学技术决策提供咨询。
中国工程院是中国工程技术界最高荣誉性、咨询性学术机构，国务院直属事业单位。具有很高的工程科学技术水平和在国际上享有良好声誉，对中国工程科学技术事业发展做出贡献或在促进我国工程科学技术界国际交往方面有重要作用的外国籍专家、可被提名并当选为中国工程院外籍院士。
二、科学成就不同
中国科学院提出了建设国家创新体系的构想，先后实施知识创新工程、“创新2020”、《“率先行动”计划暨全面深化改革纲要》，提出了《迎接知识经济时代，建设国家创新体系》、《创新促进发展，科技引领未来》、《创新2050：科学技术与中国的未来》等战略研究报告。
中国工程院先后开展联合培养博士生试点工作，实施了教育部工程科技人才培养研究专项、工程科技人才培养课题研究、举办国际工程科技发展战略高端论坛等论坛会议。在工程科学技术方面作出重大的、创造性的成就和贡献，热爱祖国，学风正派，品行端正。
扩展资料：
教育部工程科技人才培养研究专项：
据2016年10月中国工程院官网显示，中国工程院每年从咨询研究经费中列支工程科技人才培养咨询研究专项，每年经费支持额度约300万元，用于资助院士及相关专家开展工程科技人才培养方面的咨询研究。
教育部从人文社会科学研究基金中列支工程科技人才培养研究专项基金，每年经费支持额度约300万元，用于资助高校教师和相关研究人员开展工程科技人才培养方面的基础研究。
双方在每年年初根据国民经济和社会发展的需要，共同进行“工程科技人才培养研究联合资助”项目的顶层设计，并研究确定年度资助的重点领域和主要方向。
专项项目的研究周期一般为2年，在1年中由教育部和中国工程院联合进行中期检查。2015年度教育部人文社会科学研究专项任务项目（工程科技人才培养研究）一般项目共有22项课题通过评审。
工程科技人才培养课题研究：
据2016年10月中国工程院官网显示，教育委员会自成立以来，组织开展了十余项咨询课题研究，提出了50余项研究报告和咨询建议，“开发我国工程技术人员创新能力的对策研究”、“中日韩工程教育比较研究”、“关于推进我国注册工程师制度的研究”。
2006年，中国工程院启动了“创新型工程科技人才培养研究”前期研究。在此基础上，2007年正式启动了《创新型工程科技人才培养研究》重大咨询专项。
该项目涉及院士、专家众多，分为12个分课题进行研究，并且还由香港理工大学承担其中一个分课题研究。项目进行过程中组织了各类规模的研讨会、交流会、论坛十余次。
参考资料来源：百度百科-中国科学院
参考资料来源：百度百科-中国工程院
两院院士 是对中国科学院院士和中国工程院院士的统称。
中科院和工程院的区别：
1、 中科院偏向于科学研究，工程院则偏向于工程技术，就像如今推行的教育改革一样，一个是注重培养学术型人才，另一个则是注重技术技能型人才。
2、 职能的不同：中科院是个科研机构，中国工程院则不是，其成立的目的就是为了管理分散在全国各地、各个不同单位的工程院院士。
中科院院士的成长，主要靠重点综合大学和大师的熏陶；而工程院院士的成长，主要靠重点理工科大学和大量的工程技术实践而成为一名杰出的科学家或技术专家。
3、 科学院在各地都有分院，研究特定的方向和领域，自己也有大学；而工程院更像一个俱乐部性质，管理分散在全国各地、各个不同单位的工程院院士。
两院院士学历层次高，硕士以上的学历者过半。
两院”（中科院，工程院）院士均享受相当于副省/部级待遇，当然也有例外——本身是正部或以上级别的院士会享受更高级别的待遇。
选拔时间：2年一次
人数：1200人
中国科学院成立于1949年11月，是我国科学技术方面最高学术机构和全国自然科学与高新技术综合研究发展中心。
中国工程院成立于1994年，是我国工程技术界的最高荣誉性、咨询性学术机构，由院士组成，其主要任务是对国家重要工程科学与技术问题开展战略研究，提供决策咨询，致力于促进工程科学技术事业的发展。
拓展资料
自1994年开始截止2007年，中国科学院进行了8次外籍院士增选，共有来自美国、日本等国家的57位科学家先后当选中国科学院外籍院士。
直属事业单位合计114个，其中京区50个，京外64个。
参考资料：
中国工程院是我国工程技术界的最高荣誉性、咨询性学术机构，由院士组成，对国家重要工程科学与技术问题开展战略研究，提供决策咨询，致力于促进工程科学技术事业的发展。其主要任务是促进全国工程科学技术界的团结与合作，推动我国工程科学技术水平的不断提高，加强工程科学技术队伍和优秀人才的建设与培养，为国民经济的持续发展服务。
说简单点就是 中科院是个科研机构，中国工程院则不是，只是一块牌子，其成立的目的就是为了管理那一堆分散在全国各地、各个不同单位的工程院院士。
按研究领域分，一个是理科一个是工科。本回答被网友采纳