在汽车被法院查封期间，如果发生交通事故，保险公司是会接受理赔的。被法院查封的车辆只是被限制交易，但并不影响车辆的使用和保险理赔。以下是保险理赔的主要程序：
立案查验：保险公司在接到出险通知后，会立即派人进行现场查验，了解损失情况及原因，核对保险单，登记立案。
审核证明：保险公司会对投保人、被保险人或受益人提供的证明和资料进行审核，以确定保险合同是否有效，保险期限是否届满，受损失的是否是保险财产，索赔人是否有权主张赔付，事故发生的地点是否在承保范围内等。
核定责任：保险公司收到被保险人或受益人的赔偿或给付保险金的请求后，会对事实进行查验，对各项单证进行审核，然后及时作出自己应否承担保险责任及承担多大责任的核定，并将核定结果通知被保险人或受益人。
履行赔付：在与被保险人或受益人达成有关赔偿或给付保险金额的协议后十日内，保险公司会履行赔偿或给付保险金的义务。保险合同对保险金额及赔偿或给付期限有约定的，保险公司应依照保险合同的约定履行赔偿或给付保险金的义务。