怎么通过Q-PCR的扩增曲线和溶解曲线来分析结果,如何通过曲线来判断结果的好与坏?

如题所述

1、扩增曲线(如果做双ΔCT法):

(1)扩增曲线必须是S型,有明显的四个时期,且复孔的CT值尽量一致,相差不要超过0.5个CT值(上限是1个CT值);

(2)同一个基因在不同浓度的相同模板下扩增,其相差的CT值为相差浓度倍数的2次开方。当然这是理论值;另外阴性对照不能有扩增(40个循环以后出CT值属正常现象,也可算作没有扩增)。

2、溶解曲线:

(1)溶解曲线是判断扩增产物是否单一的曲线,顾名思义,其跟模板(或其浓度)没有关系,扩增什么基因就应该有其相对应的溶解曲线;

(2)一般SYBR法的目的基因在80~90℃之间;

(3)出现其他峰就该考虑是否为引物二聚体(一般为60~75℃之间)视引物长度而定,而基因组DNA污染的峰会在90℃以后。出现引物二聚体可能是引物设计、引物加量等原因所致;

(4)基因组DNA那么考虑设计跨内含子引物或者实验之前做gDNA的消除工作。而阴性对照有目的峰那可能就是模板污染,注意实验操作等避免模板污染。

3、溶解曲线是为了验证扩增产物特异性的,要是溶解曲线是单峰说明产物只有一条,结果较好;要是双峰说明产物不特异,可能存在引物二聚体或非特异性扩增,有可能引物设计有问题。


扩展资料:

溶解曲线分析:

1、可以用来确定不同的反应产物,包括非特异性产物。

2、扩增反应完成后,通过逐渐增加温度同时监测每一步的荧光信号来产生溶解曲线,随着反应中双链DNA变性,荧光染料又回复到游离状态导致荧光信号降低。

3、用荧光信号改变的负的一次导数与温度作图,在扩增产物的溶解温度上有一特征峰(Tm,DNA双链解链50%的温度),用这个特征峰就可以将特异产物与其它产物如引物二聚体区分开,

4、溶解曲线是为了观察扩增发出荧光的片段是不是需要的产物。如果溶解曲线做出来只有单峰,且出锋位置是退火温度,那么这个是产物发出的荧光,实验结果有效。

参考资料:百度百科——Realtime PCR溶解曲线

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第1个回答  推荐于2017-11-25
具体要看你做什么实验,模板和扩增的基因实怎样的。
1、扩增曲线:一般来说如果你做双ΔCT法那么你的扩增曲线必须是S型,有明显的四个时期,且复孔的CT值尽量一致,相差不要超过0.5个CT值(上限是1个CT值);同一个基因在不同浓度的相同模板下扩增,其相差的CT值为相差浓度倍数的2次开方。比如同一种CDNA5倍浓度稀释,那么同一种基因扩增的前提下,5倍浓度模板的CT值会比1倍浓度模板的CT值提前2.3个循环左右,以此类推,当然这是理论值;另外阴性对照不能有扩增(40个循环以后出CT值属正常现象,也可算作没有扩增)。
2、溶解曲线:溶解曲线是判断扩增产物是否单一的曲线,顾名思义,其跟模板(或其浓度)没有关系,扩增什么基因就应该有其相对应的溶解曲线,类似于电泳。那么你扩增几种基因就应该有几种对应的峰(一般SYBR法的目的基因在80~90℃之间),我说的是一般情况,这个跟扩增片段长短有关系。出现其他峰就该考虑是否为引物二聚体(一般为60~75℃之间)视引物长度而定,而基因组DNA污染的峰会在90℃以后。出现引物二聚体可能是引物设计、引物加量等原因(也有可能是从加完反应液到上机开始PCR这之间的时间过长)所致;基因组DNA那么考虑设计跨内含子引物或者实验之前做gDNA的消除工作。而阴性对照有目的峰那可能就是模板污染,注意实验操作等避免模板污染。
纯手打,支持下。本回答被提问者采纳
第2个回答  2013-05-09
扩增曲线要是s形的,融解曲线要单峰。满足这些条件结果才可靠追问

如果溶解曲线出现杂峰,可能是哪些原因导致的呢?没有加cDNA和加了2倍cDNA再或者是加了两种cDNA,那么它们的溶解曲线和扩增曲线有什么区别呢?

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