阿凡达是一种使用人体DNA结合潘多拉星土著居民纳美人DNA制造出的混血肉体，通过特殊的脑波链接，可以将人类的意识转移到“阿凡达”之上，就像灵魂附身，天神下凡。
人类发现了美丽的潘多拉星球，结实了智慧生命纳美人，因为人类与潘多拉星人在文化和理念上的一些差异，渐渐让极度崇敬自然的潘多拉星人与地球人之间产生了裂隙。贪婪的地球矿业公司一边资助着科学家们考察，一边利用科学家的探索结果在星球上开采稀有矿石。最终纳美人与地球人分裂，被拒之门外的地球人发现潘多拉星非常的危险，这里的动物植物甚至空气都让地球人举步维艰，为了能适应这里的环境和接近纳美人，人类利用技术制造出了混血生物体，阿凡达。
某天，一个地球战争中负伤瘫痪的海军陆战队士兵 杰克，接到了某矿业公司的邀请，去尚在开发中的潘多拉星操纵一种叫“阿凡达”的生物培育体。
因为他的科学家哥哥遭遇了街头流浪汉抢劫被刀捅死，而阿凡达是采用他哥哥DNA制作的，只能与相匹配的DNA契合。潘多拉星上的矿业公司舍不得巨额金钱制造出的“阿凡达”浪费掉，找到了拥有同样DNA的孪生兄弟，前陆战队员杰克。
杰克乘宇宙飞船与开拓者们一起来到了潘多拉星，他顿时被这里的美景迷住了。随后他进行了与“阿凡达”的链接试验，同步程度非常高。他的灵魂附身在阿凡达之上，能呼吸这个星球的空气，能甩开双脚飞奔。。。在一次附身阿凡达的野外探险中，杰克被一只危险的猛兽逼入了绝境，在丛林中跌跌撞撞的面对数值不清的掠食者，然而一个善良的纳美人女猎手带他脱离了困境，带他看到了潘多拉真正美丽的一面，带他走进了部落，部落的酋长决定，为了让人类接受纳美人的文化，他们要训练这个地球人阿凡达，让他成为一个纳美人。
杰克切断和阿凡达的连接后，受到矿业公司的武装头头蛊惑，重新回到阿凡达体内，一边尽力融入纳美人的生活，一边不断提供情报。。。。
然而，心态的变化使得他不断在人类与阿凡达的身份中挣扎，最终他觉得，矿业公司做的是错的，同时他也完全融入了纳美人的生活，成了一个标准的战士，也爱上了纳美人的女子。。。
正在这个节骨眼，矿业公司利用得到的情报，采用先进的战争机甲、武装直升机、巨型推土机摧毁了纳美人的家园，炸断了纳美人的超级大树。
杰克战胜了潘多拉上强大的飞行魔兽，骑着它召集各地的纳美人反击地球人的进攻，双方展开了殊死的战斗。
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