公务员考试程序一般为：报名---笔试----资格复审---面试---政审（这个环节要查档）---公示----正式录用。（当然涉及各地顺序略有差别，基本都是面试和资格复审的顺序互换）
填写档案存放单位的目的是为了政审环节的查档，你现在如果档案在手里应尽快办理人事代理，报名时填写人事代理机构的名称即可。你现在填错了，如果无法更改，我认为不要紧。理由我不多说：举我自己的例子：我今年报考安徽省直事业单位，档案存放地与后来查档时的存放地不一样，我在政审前告诉人家了，人家就去目前的档案存放地查档了。
你要知道公务员招考程序多，时间很长，整个程序走完一般需要半年。所以到查档时可能已经过去几个月了，这时你档案存放地发生变化很正常，如果笔试，面试都过了，政审单位一般不会在这个问题上为难你。如果你写错了，改不了，不要紧，不会影响你考上公务员。
最好是报名时就确保完全正确，不要给自己找麻烦，即是麻烦很小。
最后，要做的是抓紧备考，这些事都是不影响关键的小事，安心备考吧。
参考资料：我考上省直事业单位，了解档案相关的事。