港澳通行证的费用根据申请人的年龄、有效期限和签发地点而定，一般情况下：
1. 儿童（14岁以下）办理港澳通行证费用为人民币100元/份。
2. 成人（15-64岁）办理港澳通行证费用为人民币400元/份。
3. 老年人（65岁以上）办理港澳通行证费用为人民币200元/份。
4. 根据有效期限不同，办理5年期或10年期的港澳通行证费用也会有所不同。一般情况下5年期的费用是400元/份；10年期的费用是800元/份。
5. 办理地点也会影响到办理费用。如在大陆地区办理的话一般会额外交纳50元左右的手续费。
办理港澳通行证所需材料：首次办理须本人至户籍所在地的出入境管理处提交申请。申请材料有：居民身份证及复印件（用A4纸复印，可复印在同一张纸上）以及填写《中国公民出入境证件申请表》，2寸淡底色彩照2张（也可现场拍照，费用自付）。同时分别申请赴香港、澳门的签注；只去香港则申请香港签注，只去澳门则申请澳门签注，如果香港、澳门都去，则两地签注都要申请。《往来港澳通行证》有效期不足6个月（部分城市是3个月）的或无足够空白签注页的不能办理，须按首次申请手续办理新的《往来港澳通行证》，同时申请签注。
【法律依据】：
《中国公民因私事往来香港地区或者澳门地区的暂行管理办法》
第九条 内地公民因私事申请前往香港、澳门，须回答有关的询问并履行下列手续：
（一）交验户口簿或者其他户籍证明；
（二）填写申请表；
（三）提交所在工作单位对申请人前往香港、澳门的意见；
（四）提交与申请事由相应的证明。
第十条 本办法第九条第四项所称的证明是指：
（一）夫妻团聚，须提交合法婚姻证明，以及配偶在香港、澳门有永久居住资格的证明；
（二）去香港、澳门照顾年老体弱父母或者无依无靠的老人、儿童投靠香港、澳门亲属，须提交与香港、澳门亲属关系及其在香港、澳门有永久居住资格的证明；
（三）继承或者处理产业，须提交产业状况和合法继承权的证明；
（四）探望在香港、澳门亲属，须提交亲属函件；时间急迫的，应尽可通提交与申请事由相关的说明或者证明。
（五）会见台湾亲属或者会见居住国外的亲属，须提交亲属到达香港、澳门日期的确切证明。
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