香肠发酸一般是因为在制作过程中操作不当，或者保存不当导致香肠内部发酵所致，而发酵指的是生物体对于有机物的某种分解过程，但发酵并不代表变质，很多食物也是由经由发酵制作的，比如白酒、醋、酸奶、腌菜等。
只不过香肠属于肉类，要是发酵严重的话，会使其失去原有的营养和味道发生改变，食用价值大大下降，所以自己灌的香肠在酸味不严重，可以进行补救时才能食用。
灌的香肠存放注意事项
如果只是短期储藏，春节期间就能吃完的，灌好的香肠风干好后，只要挂在室内，然后注意经常打开门窗风透透气就行了。这样最少可保存60天左右。春节前后可吃完的，这样保存时间绝对够了。
缸内密闭保存：把香肠装进较深的缸里，即在缸内倒放一只竹篮，使香肠架空，便于透气。每放一层香肠，要用喷雾器喷一次酒。装好后，在缸上加盖、封实。加盖后，用牛皮纸封住缝隙，让它不会漏气。放在阴凉通气的地方。这样可使香肠保存6个月，风味都不变。
以上内容参考 百度百科-香肠
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