少年侦探队的百科词条里有，“◆”表示动画原创（即漫画原作中没有的）
1996年（1－42）
1 云霄飞车杀人事件
2 董事长千金绑架事件
3 偶像密室杀人事件
4 大都会暗号地图事件
5 新干线大爆破事件
6 情人节杀人事件
7 每月一件礼物威胁事件
8 美术馆杀人事件
12 步美遭绑架事件
15 消失的尸体杀人事件
17 百货公司挟持事件◆
20 鬼屋杀人事件
33 侦探团生还事件◆
36 周一晚上7:30杀人事件◆
1997年（43－85）
49 外交官杀人事件（后篇）
50 图书馆杀人事件
59 首次购物杀人事件◆
63 大怪兽哥美拉杀人事件
71 米花之狼杀人事件◆
73 少年侦探队遇难事件◆
80 流浪画家杀人事件◆
81 当红艺人绑架事件（前篇）
82 当红艺人绑架事件（后篇）
1998年（86－128）
86 诱拐现场特定事件
91 抢匪住院事件
95 小五郎约会杀人事件◆
107 鼹鼠星人之谜事件（前篇）◆
108 鼹鼠星人之谜事件（后篇）◆
109 侦探团大追踪事件◆
112 帝丹小学7大离奇事件
119 假面超人杀人事件◆
123 天气预报小姐绑架事件◆
126 旅行剧团杀人事件（前篇）◆
127 旅行剧团杀人事件（后篇）◆
1999年（129－173）
129 来自黑衣组织的女子 大学教授杀人事件★
130 竞技场无差别胁迫事件（前篇）
131 竞技场无差别胁迫事件（后篇）
135 消失的凶器搜索事件◆
136 蓝色古堡探索事件（前篇）
137 蓝色古堡探索事件（后篇）
138 最后播映杀人事件（前篇）
139 最后播映的杀人事件（后篇）
少年侦探团 (2张)
140 SOS！步美传达的信息◆
146 本厅刑事恋爱物语（前篇）
147 本厅刑事恋爱物语（后篇）
148 路面电车急刹车事件◆
156 本厅刑事恋爱物语2（前篇）
157 本厅刑事恋爱物语2（后篇）
162 飞天密室 工藤新一最初的事件★
163 月亮、星星与太阳的秘密（前篇）
164 月亮、星星与太阳的秘密（后篇）
165 少年侦探团消失事件◆
2000年（174－218）
176 与黑衣组织的再会（灰原篇）
179 咖啡店货车闯入事件◆
182 九道门大搜查◆
183 危险的处方笺◆
188 危命的复活 洞窟中的侦探团
189 危命的复活 负伤的名侦探
192 危命的复活 新一回来了
194 意味深长的八音盒（前篇）
205 本厅刑事恋爱物语3（前篇）
206 本厅刑事恋爱物语3（后篇）
209 龙神山汽车坠落事件◆
212 蘑菇、山熊和侦探队（前篇）
213 蘑菇、山熊和侦探队（后篇）
2001年（219－262）
225 生意兴隆的秘密◆
230 神秘的乘客（前篇）
231 神秘的乘客（后篇）
233 无法消失的证据（前篇）
234 无法消失的证据（后篇）
242 元太的灾难
246 陷入网中的谜团（前篇）
247 陷入网中的谜团（后篇）
252 图画中的绑架犯◆
257 匪夷所思的天谴◆
258 来自芝加哥的男人（前篇）
259 来自芝加哥的男人（后篇）
2002年（263－303）
266 情人节的真相（事件篇）
269 犯罪的纪念品（前篇）
270 犯罪的纪念品（后篇）
273 提问婆婆失踪事件◆
276 警察手册丢失事件◆
279 疯狂足球迷（前篇）
280 疯狂足球迷（后篇）
281 年幼的目击者◆
289 迷途森林的光彦（前篇）
290 迷途森林的光彦（后篇）
294 爱与决心的粉碎（前篇）◆
295 爱与决心的粉碎（后篇）◆
301 恶意与圣者的行进（前篇）
302 恶意与圣者的行进（后篇）
303 被害人回来了◆
2003年（304－344）
304 震动的警视厅 1200万名人质★
312 夕阳染红的女儿节人偶（前篇）
313 夕阳染红的女儿节人偶（后篇）
321 消失的绑架逃逸车（前篇）◆
322 消失的绑架逃逸车（后篇）◆
329 金钱买不到的友情（前篇）
330 金钱买不到的友情（后篇）
335 东都显象所的秘密（前篇）
336 东都显象所的秘密（后篇）
2004年（345－383）
346 寻找屁股上的印记（前篇）
347 寻找屁股上的印记（后篇）
348 爱与幽灵与地球遗产（前篇）◆
349 爱与幽灵与地球遗产（后篇）◆
352 钓鱼大会的悲剧（前篇）◆
353 钓鱼大会的悲剧（后篇）◆
358 本厅刑事恋爱物语5（前篇）
359 本厅刑事恋爱物语5（后篇）
360 不可思议的春季甲虫◆
363 都市的乌鸦◆
366 显而易见的码头惨剧（前篇）
367 显而易见的码头惨剧（后篇）
369 幸运儿疑案◆
370 失而复得的游戏软件◆
373 剧毒蜘蛛的陷阱◆
374 星星和香烟的暗号（前篇）
375 星星和香烟的暗号（后篇）
376 限时15时◆
377 桃太郎解谜之旅（前篇）◆
378 桃太郎解谜之旅（后篇）◆
2005年（384－424）
390 本厅刑事恋爱物语6（前篇）
391 本厅刑事恋爱物语6（后篇）
394 奇异屋宇大冒险（封印篇）
395 奇异屋宇大冒险（机关篇）
396 奇异屋宇大冒险（解决篇）
401 宝石强盗现行犯（前篇）
402 宝石强盗现行犯（后篇）
403 不可思议的天使之馆（前篇）◆
404 不可思议的天使之馆（前篇）◆
409 同时进行的舞台表演和诱拐行动（前篇）◆
410 同时进行的舞台表演和诱拐行动（后篇）◆
411 神社鸟居的惊人暗号（前篇）
412 神社鸟居的惊人暗号（后篇）
414 追逐青鸟的侦探团◆
418 米花町阁楼之家◆
421 银杏叶色的初恋（前篇）
422 银杏叶色的初恋（后篇）
423 侦探团与青虫四兄弟◆
2006年（425－459）
425 黑色冲击！被组织的魔掌触碰的瞬间★（正片之前登场）
427 超机密的上学路（前篇）
428 超机密的上学路（后篇）
435 侦探团的特别专访（前篇）
436 侦探团的特别专访（后篇）
440 极限赛车表演◆
442 被钢筋阻止的男人◆
443 叹气拾潮（前篇）
444 叹气拾潮（后篇）
453 因缘与友情的试映会
454 颠倒的结尾（前篇）
455 颠倒的结尾（后篇）
459 怪人 循规蹈矩的男人◆
2007年（460－490）
460 1年B班大作战
461 消失的一页◆
466 坚不可摧的雪人（前篇）
467 坚不可摧的雪人（后篇）
468 池塘边的怪事件◆
472 工藤新一少年冒险（前篇）
473 工藤新一少年冒险（后篇）
476 元太的必杀射门（前篇）
477 元太的必杀射门（后篇）
481 山妖婆婆的利刃（前篇）
482 山妖婆婆的利刃（后篇）
483 消失的巡警◆
488 电视台的恶魔★
2008年（491－520）
501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
507 卡拉OK包房的死角（前篇）
509 红白黄色与侦探团
510 柯南vs双重暗号之谜
511 推理对决！新一vs冲矢昴
515 怪盗基德的瞬间移动魔术★
518 明治维新神秘之旅（探索篇）◆
519 明治维新神秘之旅（解读篇）◆
2009年（521－561）
524 憎恶是蓝色火花（前篇）
525 憎恶是蓝色火花（后篇）
534 新伤痕与吹口哨的男人
535 旧伤痕与刑警之魂
536 消失名画背后的秘密◆
542 鱼儿消失的一角岩（前篇）
543 鱼儿消失的一角岩（后篇）
549 回转寿司之谜（前篇）
550 回转寿司之谜（后篇）
551 犯人是元太的父亲（前篇）
552 犯人是元太的父亲（后篇）
554 鹳的探索之旅（小兰搜索篇）◆
555 鹳的探索之旅（阳菜追踪篇）◆
2010年（562－601）
563 侦探团vs强盗团（骚乱）
564 侦探团vs强盗团（沉默）
565 没有看见的目击者◆
568 白鸟警部 樱花的回忆（前篇）
569 白鸟警部 樱花的回忆（后篇）
571 妖怪仓库中的夺宝战斗（前篇）
572 妖怪仓库中的夺宝战斗（后篇）
577 萤火虫点亮的真相◆
578 召唤危机的红色前兆
583 小林老师之恋
584 白鸟警部的失恋
585 跨越时空的樱花之恋
586 黑暗中消失的麒麟之角
587 基德vs四神侦探团
591 水族馆之家◆
597 蒸汽密室的剧本（前篇）
598 蒸汽密室的剧本（后篇）
2011年（602－641）
606 法庭的对决Ⅳ 审判员是小林澄子（前篇）◆
607 法庭的对决Ⅳ 审判员是小林澄子（后篇）◆
614 日记演奏的秘密（前篇）
615 日记演奏的秘密（后篇）
622 紧急事态252（前篇）
623 紧急事态252（后篇）
624 初恋的录像带
629 宣传片摄影事件（前篇）◆
630 宣传片摄影事件（后篇）◆
631 花时钟知道一切◆
633 时间守护者的剑（后篇）
2012年（642－680）
642 和歌纸牌千钧一发（前篇）
643 和歌纸牌千钧一发（后篇）
648 侦探事务所受困事件（爆发）
649 侦探事务所受困事件（狙击）
656 博士的视频网站（前篇）
657 博士的视频网站（后篇）
659 与初恋的共同搜查（前篇）
660 与初恋的共同搜查（后篇）
663 追逐深山锹形虫◆
664 名犬库儿的功劳2◆
669 黑暗塔的秘宝（前篇）◆
670 黑暗塔的秘宝（后篇）◆
675 一丁点都不原谅（前篇）
676 一丁点都不原谅（后篇）
2013年（681－723）
681 以性命为赌注的恋爱转播（转播开始）
682 以性命为赌注的恋爱转播（走投无路）
683 以性命为赌注的恋爱转播（现场突入）
684 泡沫、蒸汽和烟（前篇）
686 装载了定时炸弹的汽车◆
687 无人能解的冰之陷阱◆
688 高木警官捡到3000万◆
690 工藤优作未解决的事件（前篇）
694 消失老店的日式点心◆
696 花坛破坏者的阴谋◆
698 不会吧！UFO坠落事件◆
699 逼近灰原秘密的黑影（前篇）
700 逼近灰原秘密的黑影（后篇）
701 漆黑的特快列车（发车）
702 漆黑的特快列车（隧道）
703 漆黑的特快列车（交叉）
704 漆黑的特快列车（终点）
708 缓慢坠落的男子◆
720 火与水的神秘之旅（阿苏篇）◆
721 火与水的神秘之旅（熊本篇）◆
722 香甜冰冷的快递（前篇）
723 香甜冰冷的快递（后篇）
2014年（724－）
730 过于完美的模型◆
731 现场的邻居是前男友（前篇）
732 现场的邻居是前男友（后篇）
734 茱蒂的追忆与赏花的陷阱★
735 附带暗号的邀请函◆
737 疑惑的散步道◆
742 与J联盟球员的约定◆
748 本厅刑警恋爱物语（告白）
749 本厅刑警恋爱物语（真相）
750 被海背叛的男子◆
751 招财三色猫事件（前篇）
752 招财三色猫事件（后篇）
2015年（763 - ）
763 柯南与平次 恋爱的暗号（前篇）
764 柯南与平次 恋爱的暗号（后篇）
765 堤无津川放风筝事件（前篇）
766 堤无津川放风筝事件（后篇）
767 消失在暴风雪中的恋人◆
768 灰原哀监禁事件◆
769 麻烦的急救患者◆
772 工藤新一水族馆事件（前篇）
773 工藤新一水族馆事件（后篇）
774 消失的蒙克呐喊◆
777 少年侦探团VS老年侦探团◆
779 绯色的序章
781 绯色的交错
783 绯色的真相
785 太阁之恋名人战（前篇）
786 太阁之恋名人战（后篇）
792 三个第一发现者（前篇）
793 三个第一发现者（后篇）
795 年轻夫人消失的秘密◆
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