隐形守护者第六章的主要任务是为了帮助第二号脱离危险，但是主角并没有见过第二号，在火车中需要想尽办法解除第二号的危机，在这一当中不同的选择同样可以发展成两个路线。
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第六章至暗抉择攻略
1、三者任选。
2、选【庄晓曼】
3、选【你被利用了】+10，否则-1
4、选【荷包】
5、两者任选。
6、选【留在车上】或【下车找接头人】
7、选【留在车上】或【下车寻找支援】(前置为庄晓曼好感度大于等于23)
——结局分歧点!
『胡峰线』
第六章选择下车，进入胡峰线。
选【是我处决的】
选【方老师是因我而死……】(进入第七章《丛林法则》)