医学校的排名第一的是北京协和医学院，其次是北京大学医学部、上海交通大学医学院、复旦大学上海医学院、首都医科大学。
1、北京协和医学院
北京协和医学院是中华人民共和国国家卫生健康委员会直属的唯一一所医科全国重点大学，与中国医学科学院实行院校一体的管理体制，是中国国家级医学科学学术中心和综合性科学研究机构，有中国医学殿堂之美誉。
2、北京大学医学部
北京大学医学部（简称“北医”），是中国政府创办的第一所西医院校，是国家“211工程”首批建设的高等学校之一，具有百年历史，集教学、科研、医疗为一体，学科覆盖医学门类中的基础医学、临床医学、口腔医学、药学、公共卫生和预防医学、护理学、医学技术、中西医结合以及理学、工学、教育学、哲学、文学等门类的部分学科。
3、上海交通大学医学院
上海交通大学医学院由中华人民共和国教育部、中华人民共和国卫生部和上海市人民政府共建，位列“211工程”、“985工程”、“双一流”，入选中国首批“卓越医生教育培养计划”，是国家级临床技能实验示范中心学科组长单位、上海市卓越医学教育计划专家组组长单位、全国法文医学特藏中心。
4、复旦大学上海医学院
复旦是最早入选“卓越医生计划”的大学，早在70年代，复旦就已经是当时中国唯一一所国立医学大学了，不仅历史悠久，而且深受国家重视，复旦大学的重点实验室几乎是为了医学专业而打造，复旦大学上海医学院是复旦大学和上海医科大学合并而来。上医在我国医学界非常有名，实力很强。复旦上海医学院招收的医学生很少，培养精度很高。
5、首都医科大学
首都医科大学是北京市市属重点高等院校，临床医学学科具有深厚的学科积淀，外科学（神外）、眼科学、内科学（心血管病）等为国家首批博士学位授权学科，2003年临床医学获批一级学科博士学位授予权。首都医科大学拥有18家附属医院，是全国最大的附属医院集群，拥有丰富的临床医学学科资源。