中科院三大所可能指以下三个研究所：
1、中国科学院地质与地球物理研究所
中国科学院地质与地球物理研究所是从事固体地球科学研究与教育的综合性学术机构，是中国最早批准具有硕士与博士学位授予权的研究生招生和培养单位之一。研究所以固体地球各圈层相互作用及其资源、环境、工程地质问题为主攻方向；在科研布局上基本形成了地球动力学、环境与灾害、能源矿产的研究格局。
2、中国科学院测量与地球物理研究所
中国科学院测量与地球物理研究所成立于1957年，是中国大地测量领域最早的科学研究机构，也是中国科学院唯一从事大地测量学研究的公益性研究所，1970年归属国家地震局，1978年由中国科学院恢复重建。
3、中国科学院地理科学与资源研究所
中国科学院地理科学与资源研究所于1999年9月经中国科学院批准，由中国科学院地理研究所（前身是1940年成立的中国地理研究所）和中国科学院自然资源综合考察委员会（1956年成立）整合而成，并纳入中国科学院知识创新工程试点。
中国科学院的文献中心：
中国科学院文献情报中心主要为自然科学、边缘交叉科学和高技术领域的科技自主创新提供文献信息保障、战略情报研究服务、公共信息服务平台支撑和科学交流与传播服务，同时通过国家科技文献平台和开展共建共享为国家创新体系其他领域的科研机构提供信息服务。
截至2009年8月，中科院文献情报中心馆藏图书1145余万册（件），该中心启动了国家科学数字图书馆建设项目，已逐步完成了从传统图书馆向数字图书馆的模式转变，开始走上知识情报研究与知识服务中心的发展道路；同时中国科学院文献情报中心是国际图书馆协会与机构联合会（IFLA）的成员。
以上内容参考 百度百科-中国科学院
你所说的自动化所只是指“中科院自动化研究所”，不包括中科院沈阳自动化研究所，是吧？
追答是的，当然沈阳自动化也很牛，北京的自动化所是主要做理论的，而沈阳的自动化擅长工程，蛟龙深海探测船就是沈阳自动化所做的
本回答被提问者和网友采纳