农民工保证金收取标准通常按照工程合同造价的一定比例来计算，具体比例根据工程规模和风险程度而定。一般来说，保证金比例为工程合同造价的1%-3%不等。
农民工保证金是为了保障农民工的合法权益，确保他们能够及时获得工资报酬而设立的。在建筑领域，由于存在一些不法承包商和包工头，经常会发生拖欠农民工工资的情况，导致农民工生活困难，甚至引发社会不稳定因素。因此，政府部门要求建设单位在开工前必须缴纳一定比例的农民工保证金，以确保农民工工资的按时足额支付。
具体的保证金收取标准需要根据工程的具体情况进行评估，包括工程规模、工期、风险程度等多个因素综合考虑。一般来说，工程规模越大，保证金比例越高；工期越长，风险越大，保证金比例也会相应提高。
举个例子来说，某个建筑工程的合同造价为1亿元，保证金比例为2%，那么建设单位需要缴纳200万元的农民工保证金。如果工程顺利完成，没有发生拖欠农民工工资的情况，保证金将在工程竣工验收后退还给建设单位。
总之，农民工保证金的收取标准需要根据具体情况进行评估，以确保农民工的合法权益得到保障。同时，政府部门也需要加强对保证金的监管，确保资金使用的合法性和规范性。