在避雨栽培条件下，相当于北方干旱半干旱地区，病虫害防治相对较为容易，对于贯彻“预防为主，综合防治”方针十分有利。
（1）霜霉病
避雨栽培适合雨水较多的地区。我国南方地区在露地栽培葡萄霜霉病发生严重，多雨年份极难控制，而在避雨后一般不发生或轻微发生。在覆膜前使用农药科博、必备防治其他病害时可兼防该病；在揭膜前，喷施保护剂可预防该病发生危害。
（2）黑痘病
春季萌芽前喷施45%晶体石硫合剂20倍液有良好预防效果；覆膜后很少发生；揭膜以后，嫩梢稍有发生，但基本不必进行防治。
（3）炭疽病
覆膜后一般不会发病；覆膜前和揭膜后，叶片会有发生，但防治其他病害时有兼治作用，不必专门进行喷药防治。
（4）白腐病
在避雨条件下，该病害发生危害的情况会减少，但仍会发生，个别多雨年份还比较严重，尤其该病害会诱发酸腐病的产生，由此带来较大损失，因此应引起高度重视。预防该病害的主要措施是采用地膜覆盖加药剂防治。药剂可使用5%霉能灵（亚胺唑）800倍液、60%百泰（唑醚+代森联）1500倍液、25%阿米西达（嘧菌酯）1500倍液或40%氟硅唑7500倍液等。
（5）白粉病
避雨栽培葡萄的地区，葡萄生长季节多雨高湿，但在避雨栽培下此病很少发生，仅个别年份晴热少雨时会发生，主要发生在夏季。使用三唑类杀菌剂防治白腐病时，对该病有良好预防效果。
（6）灰霉病
该病在低温阴雨条件下发生较重，主要危害花穗、叶片、新梢及成熟果实，在避雨条件下的危害仍较为严重。预防该病害的主要技术措施是保持架面通风透光，降低湿度。药剂防治可使用50%异菌脲1500倍液、40%施佳乐（嘧霉胺）1000倍液、50%速克灵（腐霉利）1500倍液、50%农利灵（乙烯菌核利）600倍液等。
（7）酸腐病
近年来，该病无论是露地还是避雨栽培均有逐年加重趋势，应引起足够重视。酸腐病的发生主要是由于果实表皮受到损坏（裂果、鸟害、白腐病、炭疽病等危害后引起），醋酸菌感染发酵和醋蝇传播等综合作用的结果。防治该病的关键在于控制裂果、鸟害、白腐病和炭疽病的发生，其次是使用铜制剂杀灭醋酸菌和用杀虫剂杀灭醋蝇。
（8）蚧类
避雨栽培比露地条件下会加重危害。防治措施有：冬季期间剥除主干老翘皮，然后刷白涂剂，减少越冬虫体；萌芽前喷施45%晶体石硫合剂20倍液+必加3000倍液；葡萄生长季节，在蚧类孵化期喷施24%亩旺特（螺虫乙酯）4000倍液，并能兼治蓟马、叶蝉等刺吸式害虫。
（9）螨类
在避雨条件下发生较重。在葡萄萌芽前喷施45%晶体石硫合剂20倍液+必加3000倍液杀灭越冬虫体；生长季节，可使用24%螨危（螺螨酯）4000倍液或15%哒螨灵3000倍液有较好防治效果。
（10）叶蝉、蓟马
在避雨条件下有加重危害趋势。如发生危害，可使用25%螺虫乙酯4000倍液、5%啶虫脒2000倍液、10%歼灭3000倍液、10%吡虫啉2000倍液或阿克泰7500倍液进行防治。
（11）斜纹夜蛾
该虫主要危害葡萄叶片，严重时能将叶片全部吃光。7～9月为发生危害的高峰期。该虫应采用多种方法进行防治：斜纹夜蛾性诱剂有较好防效，在发生危害的高峰期，每天1个捕虫器可诱杀100多只成虫；安装频振式杀虫灯，对斜纹夜蛾等多种害虫都有很好的诱杀效果。药剂可使用5%甲维盐3000倍液、30亿/克甜菜夜蛾多角体病毒800倍液或25%除虫脲1500倍液等。