九年一贯制学校的利弊如下：
有利于义务教育的均衡发展。九年一贯制学校弥补了分散办学的不足，可以集中某个地区的办学优势，合理利用教育资源，有利于义务教育的均衡发展。有利于教育教学的改革。学校管理人员精简，教师所占的比例扩大，投入到教学一线过程中的资源和精力就会更多。
缓解小升初压力。小升初不用派位，家长不用操心，孩子也没有升学压力。学校规模对教师管理的影响。九年一贯制是学校规模扩大了。学校年级跨度大，教师中、小学后融合，管理难度大，并且经济待遇、考核标准、人事编制等问题也对教师管理带来相当的难度。
对教师及管理人员的能力是一个极大的考验。由于跨度较大，既小学，又懂中学的教师和管理人员是使九年一贯制发挥优势的关键所在学生所处的环境相对固定，具有相当的封闭性。学生的环境适应能力没有得到锻炼。
中小学之间的教学有着非常密切的联系，有些内容甚至大同小异，只不过小学教学要求低一些浅一些，而初中教学要求则高一些，深一些。为了激发学生的学习兴趣，提高课堂效益，我认为在小学教学中可以适当辐射到初中的内容。
为教学增添一点悬念，也为初中教学作一些铺垫，未尝不是一件好事情。如小学生背诵的一些古诗词到中学还需要更深一层的理解其内涵和写作背景，而小学阶段需要的只是初步理解这首诗的写作意图和意境。
那小学阶段就可在平时的教学中多渗透一些古诗词并将之归类，孩子在长期的吟诵中必定对古诗词的理解能摸着规律，另外对于一些基础较好的同学虽然有些内容先学可能有些难度，但从另一方面来讲也可以激发他的学习兴趣，并培养他们更多角度的解题能力和思维习惯。
不过，衔接得不好当然也存在着很大的弊端。比如对于一些基础较差的学生前面的旧知识还没吃透就要开始新的内容的学习，每天都落一点，时间长了势必跟不上班级的进程，这也就造成了差生更差的局面。
而目每年发下的书、练习都是当季的，到学期末老师在教下学期的内容时配套练习却没有及时跟上，要到下学期才来，而到了下学期又要学新内容，又要补前面的练习，老师和学生的负担都明显加重了，这又带来了新的问题。