1、两者定义不同:
（1）我们通常所说的单位职工社保一般包括：养老保险、医疗保险、工伤保险、失业保险和生育保险，简称五险。其中养老保险、医疗保险、失业保险的缴费义务由用人单位与职工共同承担，具体缴费比例每个省份都不一样，而工伤保险、生育保险的缴费义务全部由用人单位承担。
（2）灵活就业人员（个人）社保为灵活就业人员提供了最基础的社会保障，主要是起到促进劳动力合理流动和城镇化具有一举多得的效用，切实保障灵活就业人员这一特殊劳动群体的社会保障权益。
2、两者参加险种不同:
（1）单位职工社保一般包括养老保险、医疗保险、工伤保险、失业保险和生育保险，简称五险。
（2）灵活就业人员社保只参加养老保险和医疗保险，部分地区可以参加失业保险。险种比较单一。
3、两者缴费基数不同:
（1）单位缴纳社保的缴费基数为：职工上年度平均工资（高月社平的300%的，按照300%缴纳；低于社平60%的，按60%缴纳）。也就是说跟员工本人的平均工资挂钩。
（2）个人缴纳社保的缴费基数固定为高、中、低三档，供个人选择，三个档次的缴费基数在社平的60%-300%之间，选择具有灵活性。
4、两者缴费金额不同:
（1）单位缴纳社保养老、医疗和失业保险由单位和个人共同承担，单位占大头，个人占小头。另外生育保险和工伤保险均由单位缴纳。
（2）个人缴纳社保的养老保险和医疗保险的所有费用均由本人承担，缴费金额较多。
5、两者有户籍限制:
（1）单位缴纳社保不分本地或者外地，只要全日制上班均可以缴纳。
（2）个人缴纳社保须为本地人，外地只能参加职工社保，有一定的地域户口限制。