简洁版： 深度即：测序得到的总
碱基数/
基因组碱基数 。也可以理解为将基因组测了几遍。
测序深度能减少假阳性和测序错误率。 覆盖度原来是指基因/
转录组上测序测到的部分占整个组的比例，但是现在很多人把coverage也直接当depth用了。
详细版： depth嘛，就是被测基因组上单个碱基被测序的平均次数，比如某样本的测序深度为30X，那么就是说该样本的基因组上每一个单碱基平均被测序（或者说读取）了30次，注意，是平均。当然了，depth也有最大和最小值，这个都可以由信息分析得到。
coverage就好理解了，由于大片段拼接的gap、测序读长有限、重复序列等问题的存在，测序分析后组装得到的基因组序列通常无法完全覆盖所有区域，覆盖度就是最终得到的结果占整个基因组的比例。例如一个人的基因组测序，覆盖度为98.5%，那么说明该基因组还有1.5%的区域通过我们的组装和分析无法得到。
至于什么算法之类的，太深了，应该不用了解吧~~偶也写不出来。。。:P
当然，转录组也同上，