我提的质粒在0.8%的琼脂糖电泳中,跑完后条带不清晰,不知道是什么原因,谁能帮我分析一下呢???

采用常规提质粒方法,不用试剂盒,0.8%跑胶。结果如下图所示,我是哪个步骤出了问题么???
加溶液2和溶液3的时间,我是用秒表计时的,总共不到5分钟的时间,从第一个加入溶液2到最后一个加上溶液3共用了4分钟。可以把图放大了看一下,图里有两条带,不是三条,而且很弱。
我提多个质粒的时候没有问题,但是一到10几个的时候,就会挺弱的,不知道是什么问题呢??

首先你跑胶的Marker呢?电泳一定要用一个道跑Marker,以确定你的目标DNA(质粒)大小以及你的琼脂糖胶和缓冲液没有问题。
如果你的Marker跑出来没有问题,从上图看应该是你的质粒DNA浓度太高,最好质粒上样总量在500ng左右,不要超过1000ng。目标条带浓度过高容易造成拖带。
最后,质粒由于是环状,超螺旋DNA和线性DNA的电泳速度不一样,所以电泳前一定要做酶切,把环状质粒切成线状;最好在质粒上有两个酶切位点,这样酶切后可以通过两条DNA条带大小确定所提取质粒是否正确。
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第1个回答  2010-05-21
首先要有空质粒marker,否则没法判断。
此外如果不是菌液太淡的话,我觉得你在加溶液二的时候,可能没控制好时间,质粒条带一般都很亮的。
最后是下面很亮的一团,即RNA的问题,个人觉得除非有需要,RNA没除也无所谓
个人经验是:抽质粒的时候溶液2是个挺关键的因素,温度注意下,动作要轻柔有效,时间控制要合适,手感对了问题就很少了。
第2个回答  2010-05-21
加点RNA酶,缓冲液的pH值很关键
第3个回答  2010-05-21
没有除RNA
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