GAPDH,Tubulin,Actin选哪个做WB内参更好?

如题所述


探索WB实验中的上样内参:GAPDH、Tubulin与Actin的选择指南

欢迎来到“医学科研小坑”公众号,这里我们将深入探讨三种常用WB内参:GAPDH、Tubulin和Actin。这些“管家基因”因稳定表达,常用于校准实验误差,确保结果的准确性。然而,它们各有特性,如何选择?让我们一起揭秘吧!


首先, Actin,作为肌动蛋白,分布在所有真核细胞中,有多种异构体,如α、β和γ,功能多样。在不同组织中,如肌肉和非肌肉细胞,其表达量有所差异。


Tubulin,微管蛋白的组成部分,α和β型蛋白共同构建细胞骨架,例如在神经细胞中,Tubulin在轴突和树突中表达较高,而在特定组织如骨骼肌中,Tubulin的表达可能会因功能需求而改变。


GAPDH,糖酵解过程中的关键酶,表达恒定,但特殊条件如缺氧和糖尿病可使其在特定细胞中表达增加。在使用GAPDH时需注意其可能受诱导处理的影响。


比较它们在不同样本条件下的表现,如图一所示,它们的线性范围和表达稳定性各有特点。在选择内参时,考虑以下几点:


1. 表达特异性:不同组织中,管家基因的表达差异很大,如肌肉和脂肪组织中Actin的差异明显(图二)。


2. 分子量差异:确保目的蛋白与内参分子量至少相差5kD,便于分析。


3. 实验处理影响:GAPDH等可能受诱导处理影响,需谨慎选择。


4. 定位和细胞成分:做蛋白定位时,选择对应细胞组分的内参,如膜蛋白和核蛋白。


5. 总蛋白作为标准:尽管管家基因的差异性大,但总蛋白提取不受影响,线性范围更广,建议作为更可靠的选择(图五)。


总之,每种内参都有其适用场景,根据实验需求灵活选用。在必要时,考虑使用总蛋白作为内参,以确保实验结果的准确性和一致性。在提取总蛋白时,推荐使用优化的柱式法,避免蛋白丢失,确保结果的可靠性(图五)。


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